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鸟类都有类似方式的呼吸方式、辅助呼吸系统，有可能是三叠纪的原始主龙类已经演化出这种呼吸系统，而大部分后代都有类似呼吸系统，例如：恐龙、翼龙类、鳄形超目……研究人员也推测，主龙类的特殊呼吸方式，也是它们与似哺乳爬行动物的竞争过程中，逐渐占优势的原因之一。在三叠纪时期，大气层中的含氧量较低，主龙类的特殊呼吸方式，使呼吸效能较高，较具竞争优势。在2010年的一项研究，发现美国短吻鳄有独特呼吸方式。 这项研究发现，当美国短吻鳄吸气时，吸进的空气会进入第二支气管，流经交换气体的第三支气管，最后进入第一支气管。当美国短吻鳄呼气时，空气会经由第二支气管、第三支气管、第一支气管，最后从气管呼出体内。现代鸟类也有类似的呼吸方式，在呼吸过程中，空气以单向方式在气囊内流通；而哺乳动物的呼吸方式，则是反复方向的空气流通，气体在肺泡交换。除了现代鸟类以外，许多恐龙演化支也被发现拥有气囊，可以增进它们的呼吸效能。
