淡水江河边的林荫丘陵营巢(距海6万米以上)它们用尾巴扫出一个7~8米的平台,台上建有直径3米的安放鳄卵的巢,巢距河约4米,以树叶丛荫构成,每巢有白色硬壳卵50枚左右,大小约80×55毫米;母鳄鱼守候在巢侧,时时甩尾巴洒水湿巢,保持30~33℃温度,75~90天孵化;雏鳄出壳长240毫米,1年可长到480毫米,3年可达1156毫米,重5.2公斤。
在鳄鱼交配期间,公鳄发出响亮而连续的类似击鼓的声音,以招引母鳄。这时,它们昂着头,大张着嘴。婚戏通常是在水中进行的,如果公鳄在自己的领地上遇到母鳄,第一件事便是把尾巴露出水面,尾端仍留在水中呈弧形地举起作为打招呼。