“净布达哈药师咒琉璃尊”根据“药师咒法门”经过精心的设计，有以下的特点。（这些特点都是为了使其承载的水能够迅速产生稳定美好的琉璃光水结晶而设计的）
一、杯子口的边缘有“十二药叉金刚神将符号”环绕成圈，尊口边有十二符号，这些符号是十二药叉金刚神将的梵文名称，代表着十二药叉神将为“药师咒”及“药师琉璃光如来”护法，同时也能够锁定“药师咒尊”内的空间磁场，让其里面的水更能够处于接受信号状态。
二、杯身刻有“药师咒”七遍及“药师琉璃光如来”的名号。“药师琉璃光如来”的名号是药师法中最重要的组成部分，因为闻“药师琉璃光如来”名号故，而跟“药师琉璃光如来”的十二大愿产生直接的磁场共振。让尊子内所承之水都能够看闻“药师琉璃光如来”的名号而带进人的体内。“药师咒”七遍环绕杯子，让杯内所承之水能够稳定形成药师咒的磁场信号，快速产生琉璃光水结晶。改善饮用者的磁场运气。
三、杯底有“药师咒”的咒轮，此咒轮的能量非常，由“药师咒梵文种子咒心”居其中，十二药金刚神将梵文符号包围环绕，并由“药师咒梵文全文”再环绕组合而成。是药师咒梵文咒轮的经典之作。其可以表达的磁场能量，绝非一般的咒轮设计可以相比。此组“药师咒”咒轮单独使用也有强大的威德能量。
