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辣椒根腐病是辣椒常见的病害之一，各菜区均有发生，露地栽培、保护地栽培都可发病。 根腐病通常病部仅局限于根部和茎基部。植株发育不良，较矮小。后期病株白天萎蔫，傍晚至次日清晨尚可恢复，反复多日后植株枯死。
根腐病病菌以厚垣孢子、菌核或菌丝体在土壤中越冬，成为翌年主要初侵染源，病菌从根茎部或根部伤口侵入，通过雨水或灌溉水进行传播和蔓延。早春和初夏阴雨连绵、高温、高湿、昼暖夜凉的天气有利发病，种植地低洼积水，田间郁闭高湿，茎节受蝼蛄为害伤口多，或施用未充分腐熟的土杂肥，会加重病情。连作地、低洼地、粘土地发病重。
防治方法
(1)精选品种。选好并整好育苗地块。选择优质品种，并对种子进行浸种处理，并适期播种。
(2)实行与豆科、禾本科作物进行3~5年轮作。
(3)田间管理。精耕细整土地，悉心培育壮苗，在移植时尽量不伤根，精心整理，保证不积水沤根，施足基肥。采取高畦（垄）栽培。避免大水漫灌，雨后及时排水，防止田间积水。灌水和雨后及时中耕松土，增强土壤通透性，促进根部伤口愈合和根系发育。定植后要根据气温变化，适时适量浇水，防止地上水分蒸发、苗体水分蒸腾，隔绝病毒感染。
(4)定植后温度控制在20~30℃、地温25℃、湿度不高于90%。使幼苗茁壮成长。
(5)分别在花蕾期、幼果期、果实膨大期页面喷施如金根腐病专用，该菌剂可以固氮、解磷、解钾，能充分利用空气中的氮，通过有益菌生长代谢产生相应的酶和酸，可对土壤中难溶性的磷、钾进行分解，便于植物吸收。如金菌有益菌群可以增强植株营养匹配功能，使果蒂增粗，促椒体健康生长，增强抗病能力。
