发酵床分解粪尿的能力主要取决于发酵床菌种的活力，菌种活力越强新陈代谢就越旺盛。要保障发酵床菌种旺盛的新陈代谢能力，提高分解粪尿的效果，就是要保障菌种的生存环境。多年实践证明，影响发酵床养猪粪便分解的因素有以下几个方面：
（1）菌种活性
发酵床发酵分解粪尿的过程是微生物新陈代谢的结果。所以，发酵床菌种活力的高低决定了粪便分解和垫料发酵的效率，是发酵床制作的首要关键因素，因此制作发酵床一定要选择活力强大的菌种。使用发酵床菌种行业老品牌“农富乐发酵床菌种”。
（2）垫料原料
菌种不断繁殖所需要的最/佳碳氮比是25：1。猪粪尿的碳氮比是7：1，主要提供氮元素，而且是持续产生的。垫料原料主要提供碳元素，所以其碳氮比越高，功能菌合成新细胞的速度也就越快、数量越多，垫料的使用效果也就越好，使用年限也就越长。
（3）透气性
发酵床中的功能菌多是耗氧性微生物，氧气的供给是耗氧性微生物增长繁殖不可缺少的，因此在平时的发酵床管理中要多注意垫料的透气性，做到及时翻倒。
（4）水分
水分是影响微生物生命活动的重要因素，微生物在发酵床垫料里进行着生命活动。同时，水分也影响垫料内部的养分和微生物的移动，影响发酵效率的高低，也影响空气成分和垫料及猪舍内的温度。
（5）厚度
参与发酵的微生物，通常在30℃以上的环境温度下，增殖变旺盛。所以，发酵床的厚度是决定温度的重要因素，发酵床养猪一般要求垫料厚度为50cm以上，占地不得小于20平米。结合实际使用情况来讲，影响的因素有：菌种的选择、垫料的选择、当地的圈舍结构、地下水位、圈舍的单位饲养密度和发酵床的维护情况。经用户反应：只要发酵床维护得当，可以持续使用3～5年。发酵床养殖，省工省料，制作简单，后期维护方便等诸多优点已被广大养殖户所青睐。
（6）养殖密度
不同的菌种活性不同，分解粪尿的速度也不同，所以，单位面积内的粪便过多，可能超出菌的分解能力，不能在有限的时间内及时分解掉粪便；所以，应保持合理的养殖密度，确保粪便及时快速分解。
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