经过益生菌微生物发酵过的粪便能够提高动物免疫系统功能，可提高动物机体抗体水平，产生干扰素、免疫球蛋白，激活巨噬细胞的活性。对消化道、呼吸道、细菌、病毒都有一些作用。发酵过的粪便，扭转了蛋白质的有害转化，减少了粪便中氨气等，因而提高了营养物质的利用、也减少了粪便中氨、磷的含量、减少了水体富营养化保证了动物机体、环境良性互动、动态平衡、循环持续健康发展。
利用益生菌发酵粪便原理是通过生物夺氧方式阻止粪便中的病原菌的繁殖；通过产生代谢产物和生理活性物质杀害粪便中的病原微生物，同时发酵过的粪便种产生多种消化酶、提高粪便营养成份的利用率；被微生物分解过的粪便产生有机酸、营养物，还能够激活粪便中的酶原；菌体本身为动物提供营养；合成消耗维生素；影响氮元素代谢；影响糖类物质代谢；影响脂类物质代谢。
鸡肠道短，吃进的饲料消化利用不充分，大量的营养物质，随粪便排出。鸡粪的营养物质含量与鸡的生长时期和鸡的经济用途有一定关系，肉仔鸡由于是高能量，高蛋白质饲养，其粪便中营养物质含量较高，蛋鸡粪则含钙量很高。
发酵方式：
挑选新鲜健康的鸡粪60％、秸秆粉或米糠、麦麸40％掺和成混合料；以100公斤混合料加入1公斤益富源EM菌液，控制水含量在50％左右（视干湿度增减水量）混合均匀，采用先好氧发酵至料温达到40-50度时，然后进行密闭厌氧发酵。环境温度25-35度条件下发酵15-30天。成功的鸡粪发酵料曲香而不臭。将发酵的鸡粪料以一定比例掺到日粮中饲喂。育肥猪可掺入40-80％，猪很爱吃，无病，皮毛红润发亮，喜睡，能替代百分之五十的精饲料，每头猪饲料成本节省上百元，值得大力推广。
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