菠菜种子充分成熟后容易脱粒，又由于菠菜种株各部位开花的先后不同，导致种子成熟期不一致。因此，当种株有1/3—1/2变黄时，就应全部收获，收获应在早晨露水未干时进行为宜，收获后的种株，在干燥的地方堆置几天时间，以待种子后熟，然后抢晴天让其充分干燥脱粒。
菠菜在有刺种与无刺种间的一代杂种优势明显，且采种量也多，因此，国内外生产中正在大量使用一代杂种。生产杂种的方法有以下二种。
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