温室或其他结构是植物工厂正常生产的基础，也是植物工厂想要周年生产的配套，另外还需要其他很多配套设施，主要有：营养液循环及其控制系统、环境控制系统、立体水培栽培系统、人工光源、计算机智能控制系统等。
营养液循环系统及控制系统
营养液栽培是植物工厂主要的栽培方式，目前较为流行的是DFT和雾培两种，这两种都是能够实现封闭式自循环及封闭式的栽培模式。封闭的自循环营养液系统是由营养液池、传感器、循环水泵、过滤及消毒系统、电磁阀、管道、栽培床以及自动控制的系统组成。整个系统在运行过程中，有传感器采集信息，有自动控制系统控制整个温室的环境，包括营养液的的属性都可自动调节，控制营养液通过循环管路，至栽培床，在为作物提供营养后经由消毒过滤再次回到营养液池，完成循环。
2.立体水培系统
早期的栽培床通常只有一层，因为早期使用高压钠灯为补光灯，发热量较大，即便是两层，间距也在一米以上。不过随着冷光灯的应用，栽培床的间距大大减小到三四十厘米，栽培床变为三到四层，有的甚至达到十层以上。这种类型的水培立体栽培技术，通常由固定支架、人工光源、栽培槽、防水膜、栽培板、进排水管等管路组成，将自循环系统与循环管路连通，就可实现立体多层栽培，可以大幅提升空间利用率以及单位面积产量。
3.环境控制系统
环境控制系统是植物工厂重在的组成部分之一，可以控制环境的温度，湿度，二氧化碳浓度，光强等环境因素，以及EC/PH液温等。环境控制系统由传感器，控制器，执行机构三部分组成。传感器是采集信息的重要工具，传感器有很多类型，根据需采集的不同环境因素来选择。执行机构有：空调系统、加湿除湿器、CO2释放系统、光照、营养液、液温及增氧装置等。
4.人工光源系统
光源是植物进行光合作用的基本能源，光的调节也是尤为重要，在封闭的植物工厂中，植物的生长，主要依靠的就是人工光源，目前多使用的是LED，LED体积小，寿命长，耗能低，发热地，可近距离照明，可以控制发光质，能够促进植物发育，提高产量，缩短了栽培曾的距离。
5.计算机控制系统
计算机控制系统，简称智控系统，是植物工厂的心脏，所有信息进过传感器收集，传入计算机系统，进行计算，分析，判断，在执行相关操作。目前可实现计算机自动控制，手动控制，手机端遥控控制能功能。
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