为提高防治效果，做到无公害化生产，在进行化学防治时应注意做到：
（1）科学选药，对症下药 选择高效、低毒、安全、无污染的农药，合理配药，切勿随意提高使用倍数和几种不同性质的农药胡乱混配，以免发生药害、造成药品失效。例如含铜锰锌等农药，与含磷酸根的叶面肥混用，则铜锰锌等金属离子会被磷酸根固定而使农药失效。
（2）交替使用农药 切勿一种农药或几种农药混配连续使用，以免产生抗药性，降低防治效果。但有些制剂如中草药制剂靓果安、溃腐灵、青枯立克等，其安全性高、没有抗药性，可连续用药，积累效果更好。具体用药方法须参照说明书，不能主观猜测。
（3）切勿重复喷药，以免发生药害。
（4）灭虫时应尽量选用生物农药 例如苏云金杆菌、青虫菌、杀螟杆菌等，这类药品对人畜安全，不污染环境，对有益昆虫无杀伤力。对害虫不产生交替抗性，其选择性强，既能保护天敌、维护生态平衡，又能有效的控制害虫为害。
（5）提高配药质量和喷药质量 用药适应科学的添加中草药制剂、有机硅等增效剂，以提高防效。只要不是含磷、硫、强酸强碱性农药添加中草药制剂，不但可以提高植株抗性与防治效果，而且可以减少药品的使用量和喷洒次数，起到事半功倍的效果；掺加有机硅可以显著提高药剂的展着性、渗透性、浸润性，提高防效。
多数病菌都来自土壤，且叶片反面的气孔数目明显多于正面，病菌很容易从叶片反面气孔中侵入，引起发病。因此，喷药时要做到喷布周密细致，使叶片正反两面、茎蔓、果实、地面都要全部着药，更要着药均匀。
（6）用药应及时、适时，真正做到防重于治 每种药品都有一定的残药期，如果用药间隔时间太长，势必给病虫提供可乘之机，对番茄造成危害。
（7）消灭病虫要做到彻底消除 温室栽培跟大田栽培不同，因其封闭严密，在灭虫防病时，要做到彻底干净，坚决铲除，以免留有后患。
（8）温室栽培番茄，严禁使用高残留，剧毒农药。
