张仲景为《伤寒杂病论》合十六卷，今世但传《伤寒论》十卷，杂病未见其书，或于诸家方中载其一二矣。翰林学士王洙在馆阁日，于蠢简中得仲景《金匮玉函要略方》三卷：上则辩伤寒，中则论杂病，下则载其方，并疗妇人。乃录而传之士流，才数家耳。它以对方证对者，施之于人，其效若神。然而或有证而无方，或有方而无证，救急其有未备。国家诏儒臣校正医书，臣奇先核定《伤寒论》，次校定《金匮玉函经》，今又校成此书，仍以逐方次于征候之下，使仓卒之际，便于检用也。又采散在诸家之方，附于逐篇之末，以广其法。以其伤寒文多节略，故断自杂病以下，终于饮食禁忌，凡二十五篇，除重复合二百六十二方，勒成上、中、下三卷，依旧名曰《金匮方论》。臣奇尝读《魏志·华佗传》云：“出书一卷曰：此书可以活人”。每观华佗凡所疗病，多尚奇怪，不合圣人之经，臣奇谓活人者，必仲景之书也。大哉炎农圣法，属我盛旦，恭惟主上，丕承大统，抚育元元。颁行方书，拯济疾苦，使和气盈溢，而万物莫不尽和矣。
这时候，东汉王朝四分五裂，张仲景官不能做，家也难回。于是他就到岭南隐居，专心研究医学，撰写医书。到建安十五年，终于写成了划时代的临床医学名著《伤寒杂病论》，共十六卷。经后人整理成为《伤寒论》和《金匮要略》两本书。《伤寒杂病论》系统地概括了“辨证施治”的理论，为中国中医病因学说和方剂学说的发展做出了重要贡献。后来该书被奉为“方书之祖”，张仲景也被誉为“经方大师”。
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《伤寒论》以伤寒命名，伤寒二字有广义和、狭义之分。如《素问·热论》说：“今夫热病者，皆伤寒之类也。”广义伤寒是一切外感疾病的总称，“伤寒有五，有中风，有伤寒，有湿温，有热病，有温病。”《伤寒论》是外感疾病并包括某些杂病在内的辨证论治的专书。
尽管张仲景从小就厌恶官场，轻视仕途。但由于他父亲曾在朝廷做过官，希望张仲景能够在朝廷谋得一官半职。古时的人以不忠不孝为大耻辱，尽管张仲景很不情愿，但也不愿违背父命，落下一个不孝之子的名声。因此在灵帝时（约公元168～188年），举孝廉，进入官场。在建安年间（公元196～219年），张仲景被朝廷派到长沙做太守。但他仍用自己的医术，为百姓解除病痛。在封建时代，做官的不能随便进入民宅，接近百姓。可是不接触百姓，就不能为他们，自己的医术也就不能长进。于是张仲景想了一个办法，择定每月初一和十五两天，大开衙门，不问政事，让有病的百姓进来，他端端正正地坐在大堂上，挨个地仔细为群众诊治。他让衙役贴出安民告示，告诉老百姓这一消息。他的举动在当地产生了强烈的震动，老百姓无不拍手称快，对张仲景更加拥戴。时间久了便形成了惯例。每逢农历初一和十五的日子，他的衙门前便聚集了来自各方求医看病的群众，甚至有些人带着行李远道
《金匮要略》
而来。后来人们就把坐在铺里给人看病的医生，通称为“坐堂医生”，用来纪念张仲景。张仲景看到百姓对他非常信任，在医术上更加精益求精，不断探索。他大量采集民间验方，进行认真研究。有时甚至不畏路途遥远，拜师取经。有一次他听说襄阳城里同济堂有个绰号“王神仙”的名医，对扼背疮很有经验。他立即带着行李，长途跋涉几百里，去拜“王神仙”为师。对“王神仙”在性、医道各方面的独到之处都用心学习研究，获益很大。
虽然张仲景的医术非常高超，但有些病他也不能医治。俗话说，“大兵之后，必有灾年”。东汉末年，战乱频繁，不断的战争导致瘟疫流行。建安年间，瘟疫大流行，前后达5次之多，使很多人丧生，一些市镇变成了空城，其中尤以死于伤寒病的人多。如张仲景的家族，原来有200多人，自汉献帝建安元年（公元196年）以来，在不到10年的时间里，就死了三分之二，其中有十分之七是死于伤寒病。一些庸医便趁火打劫，不给病人认真诊脉，
本书撰于3世纪初，作者原撰《伤寒杂病论》十六卷中的另一部分。经晋王叔和整理后，其古传本之一名《金匮玉函要略方》，共3卷。上卷为辨伤寒，中卷则论杂病，下卷记载方。后北宋校正医书局林亿等人根据当时所存的蠹简文字重予编校，取其中以杂病为主的内容，仍厘订为3卷，改名《金匮要略方论》。
张仲景写成该书后仍专心研究医学，直到与世长辞。晋武帝司马炎统一天下后的公元285年，张仲景的遗体才被后人运回故乡安葬，并在南阳修建了医圣祠和仲景墓。
张仲景的《伤寒杂病论》大约成书于东汉末年（公元200——210年），其内容包含伤寒和杂病两部分，共十六卷。西晋时代的太医令王叔和，将原书的伤寒部分整理成册，名为《伤寒论》。至唐代孙思邈将《伤寒论》全书载于他所撰述的《千金翼方》，这是我们能见到的《伤寒论》早的本子。到了宋代，经林亿等人加以校正，《伤寒论》才得以行世。现在通行的《伤寒论》有两种版本，一是宋版本，一是成注本。宋版本国内已无原刻本，只有明代赵开美的复刻本，也称赵刻本。成注本是金代成无已注释的。北宋初期，翰林学士王洙在翰林院残旧书籍中得到《金匮玉函要略》，是《伤寒杂病论》的节略本，共三卷，经林亿等对此进行校订，把这三卷中论述杂病和妇人病的部分整理编篡成《金匮要略》。
