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不仅动植物的遗体能形成化石，而且表明它们曾经存在过的证据或踪迹也都能形成化石。痕迹化石能提供有关该生物特点的相当多的情况。很多壳、骨、叶以及生物的其它部分，都能以阳模和阴模的形式保存下来。如果一个贝壳在沉积物硬化成岩之前就被压入海底，它的外表特征就会留下压印（阴模）。如果阴模后来又被另外一种物质充填，就形成阳模。阳模能显示出贝壳本来的外部特征。外部阴模显示的是生物体硬部分的外部特征，内部阴模显示的是生物体坚硬部分的内部特征。
据参与这项研究的古生物学家介绍，“煤龟”生活在古新世晚期，当时恐龙已灭绝约500万年，同时代生活着众多巨型爬行类动物，例如迄今发现的大蛇类体长达13米的塞雷洪泰坦莽。这主要是由于天敌减少、栖息范围扩大、食物充足以及气候温暖（当时全球气温比现在高11摄氏度）等因素，为这些巨型动物的繁衍提供了良好的综合环境。此外，“煤龟”体型如此大也是这一物种为避免成为其它巨型动物的美食而在自然选择下进化的结果。
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科考人员还对乌龟壳进行复原。“活的乌龟壳表面是一层角质盾片，共13片，而当乌龟死后这些盾片就脱落了，露出骨质的壳，我们通过骨板上的凹槽复原了龟壳，可以看出乌龟的形状大小。”周长付说。
据悉，美国北卡罗来纳大学的古生物学者在南美洲哥伦比亚的一座煤炭矿坑中，发现了这种巨龟化石。据推测，这种巨龟是在恐龙灭绝500万年后出现的，生活在距今6000万年前的时代。
生物身体的柔软部分在东波兰的饱含油的土壤中也发现到，在这里有保存很好的一种绝灭的犀牛的鼻角、前腿和部分皮。在新墨西哥州和亚利桑那州的洞穴中和火山口里发现了地树懒的天然形成的木乃伊。这里的极端干燥的沙漠气候能够使动物的软组织在腐烂之前就全部脱水，并能保存部分的皮、毛、腱、爪等。
“这是科考队在开展古生物考察时，以逛街扫街的方式发现的，当时大片的乌龟化石被风化而裸露出来。根据一平方米范围内乌龟化石的数量推测，至少有上千只乌龟化石，我们判断这些都是淡水龟。”周长付说。
虽然生物体的软组织的保存形成了一些有趣的和令人叹为观止的化石，但这种方式形成的化石是相对罕见的。古生物学家更经常地是研究保存在岩石中的化石。
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