EM菌的具体作用
改良土壤
1. 形成适于作物生长发育的良好环境，改良土壤结构，促进团粒化，提高土壤肥力，使土壤的渗水、保水、透气能力增强，可逐年减少化肥、农药使用量。
2.加速土壤有机物的分解，使有效养分含量明显增加；使土壤中有效微生物迅速繁殖和不断补充，抑制了土壤中病原微生物的侵袭和发展。
3. 促进以微生物及其分解产物为食的土壤微型动物(如有益螨、蚯蚓类和甲虫类)的数量增加，使整个耕层的微生态系统组成发生根本变化，提高了土壤生物活性和缓冲能力。
促进植物生长发育
1. 施用EM菌可增强植物叶片光合能力，如叶面喷施EM菌液的果树，叶片增厚、发亮。
2. EM菌可促进根系生长，花果期使用还能有效提高坐果率。
3.重茬地块施用EM菌，可明显促进长势，提高产量。
提升植物抗病抗逆能力
1. EM菌可产生大量有益物质，如氨基酸、有机酸、多醣类、各种维生素、各种生化酶、促生长因子、抗生素和抗病毒物质等，提高作物的抗逆性。
2.提高水中的溶解氧浓度，有利于根系呼吸；可提高土壤保水能力，同时可强化叶片保护膜，减少水分损失。
3. 抑制有害微生物的生存与繁殖，减轻并逐步消除土传病虫害和连作障碍。
提高作物产量与品质
1. 增加作物产量。研究表明，一茬作物每亩施用EM发酵稀释液0.5~1公斤，增产幅度一般为：粮油作物增产10~20%以上，其中大豆可增产10%以上；叶菜类增产8~26%以上，块根块茎类增产幅度更大；瓜果类保花保果率提高40%以上。
2. 提高作物品质。瓜果类或果树在施用EM菌后，单果重、含糖量等明显提高；花卉可提前半月开花，花朵增多更鲜艳，花期延长。
3. 延长果品保鲜期。果树采前喷施EM菌，不但能给叶片补充营养， 还能使果实保鲜期延长。采后用EM菌稀释液浸泡果实2分钟，晾干再贮藏，同样能使保鲜期延长。
抑制与消除杂草
EM菌中的乳酸菌群合成乳酸和生理活性物质，可使杂草种子的种皮变软，容易吸收水分，打破休眠，提前发芽，使其因无法越冬而枯死。
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