化石还可以通过矿化作用和石化作用而保存下来。当含矿化的地下水把矿物沉淀于生物体的坚硬部分所在的空间时，使得生物的坚硬部分变得更坚硬、抵抗风化作用的能力更强。较普通的矿物有方解石、二氧化硅和各种铁的化合物。所谓置换作用或矿化作用是生物体的坚硬部分被地下水溶解，与此同时其它物质在所空出来的位置上沉淀下来的过程。有些置换形成的化石的原始结构被置换的矿物所破坏。
美国古生物学者在南美洲哥伦比亚的一座矿坑中发现了一种巨型乌龟化石。据推测，这种巨型乌龟生活在距今6000万年前，体型庞大，甚至可能以捕食鳄鱼为生。
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科考人员还对乌龟壳进行复原。“活的乌龟壳表面是一层角质盾片，共13片，而当乌龟死后这些盾片就脱落了，露出骨质的壳，我们通过骨板上的凹槽复原了龟壳，可以看出乌龟的形状大小。”周长付说。
古生物学者表示，这种巨龟体型庞大，大小如同一辆汽车一般。它的头骨就有一只足球大小，下颚骨相当有力，可能以软体动物、小型乌龟，甚至是鳄鱼为食
据参与这项研究的古生物学家介绍，“煤龟”生活在古新世晚期，当时恐龙已灭绝约500万年，同时代生活着众多巨型爬行类动物，例如迄今发现的大蛇类体长达13米的塞雷洪泰坦莽。这主要是由于天敌减少、栖息范围扩大、食物充足以及气候温暖（当时全球气温比现在高11摄氏度）等因素，为这些巨型动物的繁衍提供了良好的综合环境。此外，“煤龟”体型如此大也是这一物种为避免成为其它巨型动物的美食而在自然选择下进化的结果。
在鄯善县境内，有一处特别的“墓地”，这里埋葬了上千只侏罗纪时期的乌龟骨骼化石，且数量丰富保存完整，实属罕见。近日，以乌龟化石为主题的纪录片《乌龟的墓地》在电视台10套播出了。
这些生活在1.65亿年前的乌龟们到底是什么品种，为何会大量埋葬在一起，在它们死前发生了什么，它们和现在存活的乌龟有什么不同，当时的鄯善又是什么样的？昨日，记者通过电话联系到沈阳师范大学古生物研究所博士周长付，他是发现乌龟化石科考队的专家之一，他将为读者揭秘神秘的“乌龟墓地”。
生物变成化石的更有趣和不寻常的一种方式就是在琥珀中保存。古代的昆虫可被某些针叶树分泌出的粘树胶所捕获。当松脂硬结后并进一步变成琥珀，昆虫便留在其中。有些昆虫和蜘蛛被保存得非常好，甚至能在显微镜下研究它的细毛和肌肉组织。
