林风眠绘画的大特点是用色大胆，极富创造性。为了强化作品的表现力，他创造性地将水墨与水粉、水彩交替复合使用，产生浑厚强烈、丰富多变的艺术效果，这是一大创举。如他上世纪60年代画的《秋》，运用大面积耀眼的水粉色突出金秋的感觉，使人印象深刻。这种墨、粉混用的画法还有一大好处，即便于修改，色彩与笔触的重叠使修改成为可能，林先生曾说，他的画有些是改好的。林风眠将水粉大胆引入到水墨中，是对中国画改革的一大贡献。
在构图上林风眠也独具一格，充满新意，具有高度的形式美感。他特别偏爱方形构图，不喜画立轴、横幅、手卷，也不凭借题诗、书法增色，只有一个签名，简单至极。他的画讲究构成，强调装饰性，吸收了西画马蒂斯、塞尚的长处，他画的许多静物明显有此二人的影子。如《水果》、《窗前》，那极富装饰性的曲线、图案及画面的安排处理，都脱胎于西画。林风眠还格外重视对比的运用，黑与白、方与圆、疏与密、厚与薄、动与静、明与暗都被他大开大合、错综于一起，既醒目又合谐。如他画的许多《仕女》，人物袖口与颈部用勾涂，与黑暗的底色形成鲜明的对比。
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伴随着内地市场“林风眠热”的兴起，一些投机者闻风而动，真品纷纷面世，混迹拍场。仕女、山水、静物都有仿造，尤其以他招牌式的《白鹭》、《秋鹜》、《仕女》数量多，百万以上成交屡见不鲜，甚至上世纪40年代的早期作品也成为造假对象。近一两年伪作呈明显增多之势，特别是山水、静物、戏剧人物等品种，买家应保持高度的警惕，严防上当。
早在2005年，在古玩文化艺术品交易四季拍卖上，林风眠的《鸡冠花》就曾拍出324.5万元的不菲价格，同年在保利上海春拍其人物画《小薇》更是拍出506万元的高价，在当时已经是很不错的价格了。但随后林风眠的市场始终没有出现太大的上涨，10年来停滞不前。林风眠画作在低位徘徊究其缘由，一方面是受伪作过多的冲击，藏家担心买到真品不敢出手，使真品价格受到影响；同时跟其作品多为四尺斗方小幅缺乏巨制也有不小关系。2011年香港佳士得春拍其8尺画作《秋山深居》拍出1930万元的高价，但对林风眠来说，这样大小尺幅的画作毕竟凤毛麟角。
长期以来，由于真品泛滥、买家缺乏了解等诸多原因，林风眠绘画在市场中一直受到冷落，作品价位在低位徘徊，与其同时期的几位大师如徐悲鸿、齐白石、黄宾虹、潘天寿、李可染、傅抱石等相比无可比肩，甚至屈尊于二流画家的尴尬境地。如此严重扭曲与偏离的市场表现与定位，与林风眠在现代中国美术史上的杰出地位与贡献不符。市场终将对这种不合理的价值偏离做出校正，回归其应有的市场价值。有眼光的、理性的收藏家也绝不会被暂时的市场失真所迷惑。
在现代美术史上，林风眠不仅是位开拓者、奠基者，在中国画改革上更是一个积极实践者，他在融汇中西上所取得的杰出成就是鲜人可比的，为中国画开拓了一方新天地。当前，虽然其画作已实现了初步的价值回归，但还远未达到应有的合理价位，与其同时期的几位大家还相差甚远，未来在国内精品突破千万大关为期不远。
1925年，林风眠学成归国，在蔡元培支持下任北平艺专校长，后迫于政治原因到杭州创办国立艺专。这一时期，林风眠的艺术是入世的，描绘劳苦大众，直面社会人生，成为他绘画的主题。先后创作了《人道》（1927年）、《痛苦》（1929年）、《悲哀》（1934年）“三部曲”，同时在教学中，林风眠强调“中西并学，重视传统”，不要有门户之见，对学生们艺术道路的发展大有裨益。