基本农田保护是耕地保护的重心。针对当前基本农田保护工作中存在的种种问题，笔者认为，目前我国的基本农田保护需要注意做好以下工作：
1.完善基础数据，摸清底数，在全国范围内开展耕地详查。目前实施的规划是以1996年土地详查数为基数，而到2000年基本农田划定时，耕地面积已经发生了变化。一是有些地方发生了水灾，造成耕地及基本农田减少，减少部分没有从耕地面积中扣除。二是1999年1月1日实施新《土地管理法》以前，即年我国建设占用尚未实行“占一补一”。三是有些地方较早开始生态退耕，一些有坡度的基本农田退为林地。这三项客观原因造成按土地利用总体规划确定的基本农田保护数偏大。因此，应注意摸清1996年详查结束后耕地的变化情况，尤其是基本农田的数量与分布，重点查清现在基本农田的数量与分布与划定时相比发生了哪些变化，质量上有多少降低。建立全国耕地保护数据库，进行全国范围的动态监测，更好地实施宏观调控。
2.确定合理的保护目标。摸清耕地基数后，实事求是地确定基本农田保护率，要给发展留下空间，增强规划的严肃性，基本农田的位置、面积一经确定，就不允许减少和占用，加强用途管制，规划的调整权适当上收，真正保护能够保下来的面积。
3.基本农田保护率不能全国一刀切，要根据东中西部不同的发展状况，因地制宜，下达可行的保护率。
4.在全国范围内重新调整划定基本农田，将基本农田保护的范围缩小，质量提高。明确保护的概念。保真正该保的优质农田。对基本农田的内涵作出明确的界定，对基本农田作出明确定义，清楚地描述其性状，对坡度、位置、产量、等，严格按此标准划定。
5．把基本农田保护作为政府的责任，由政府一把手亲自抓。基本农田管理不仅仅是国土资源管理部门的事，更是政府的责任，仅仅提出“基本农田保护是一条红线”还不够，要像计划生育政策一样，实行基本农田保护党政领导一票否决制。对在任期内没有做好基本农田保护工作，发生基本农田被非法占用、毁损等情况的，要严肃处理。
6.发动农民，建立自下而上的监督体系。目前的基本农田保护还处于政府保护阶段，还不是农民自发的保护。今后应建立自下而上的监督体系，让每个农民都成为监管员，并保证监管渠道畅通。同时让农民真正能够从土地中获益，如果农民真正靠土地为生，土地是其全部生活依赖，那么任何人乱占乱用农民起来监督。建议部里设立举报电话，设专人接听，免费拨打，并做到对每一起举报都有查处结果通报，对情况属实的举报要进行奖励。
7．对承包地是基本农田的农户给予补贴。承担基本农田保护责任的农户，其承包地没有机会转变为建设用地，也没有进行农业结构调整改种其他高产值的经济作物可能，本应由政府承担的保护基本农田的职责，变为由农户承担，因此政府应给这部分农民以补贴，把农户不能转为其他用途土地和改种其他经济作物的损失由政府承担，这样农民就会有保护基本农田的积极性。这其实是对发展权限制的补贴。
8.提高用地成本，挖潜土地潜力，促进土地集约利用。提高征用土地的成本，用经济手段促进用地者集约用地。定期公布土地闲置率，对有闲置土地的地方，不再下达建设占用指标，引导土地集约利用。用经济手段保护基本农田，提高用地成本。经济手段要远比行政手段简单。
9．建立基本农田监控体系。一是部里建立全国的基本农田图件系统，掌握每一宗基本农田的位置。二是建立基本农田保护监督员制度。聘请一些群众监督员，发现问题随时举报。三是利用卫星航片进行监测。四是对违法案件查处结果要及时通报。
10．对基本农田进行分级分类保护。按照地块的面积、土壤肥力、水利设施等条件，对基本农田进行分类，一级由国家直接管理，永久保护，永远不能占用；二级地由省负责保护管理，只有国家能源、交通、水利等重点工程才能占用；三级地由地市负责管理，为满足城镇化与工业化需求，可以占用部分，但要严格把关，必须符合土地利用总体规划，却属城市建设所必须；四级由县市负责管理。目前，福建省已在试行这种办法。
11.做好相关政策的梳理。国家关于基本农田保护，出台统一的政策，不要几个不同部门的政策相互矛盾，做好国土资源管理与林业、环保等部门的协调。
基本农田保护界桩的作用
我国人口多耕地少,耕地后备资源不足,维护粮食安全,保持社会稳定,始终是我国的一个重大问题.划定基本农田保护区的根本目的,就是为了对基本农田实行特殊保护,以满足我国未来人口和国民经济发展对农产品的需求,为农业生产乃至国民经济的持续、稳定、快速发展起到保障作用.
划定基本农田的意义和作用主要表现在以下几个方面：
,通过划定基本农田保护区进一步宣传了《中华人民共和国土地管理法》和“十分珍惜、合理利用土地和切实保护耕地”的基本国策,增强了全社会保护耕地的意识.
第二,通过划定基本农田保护区协调了农业用地与建设用地的矛盾,比较好地处理了“一要吃饭,二要建设”的关系.
第四,通过划定基本农田保护区稳定了农民承包土地的思想,调动了农民的生产积极性.
第五,通过划定基本农田保护区增加了对基本农田投入,加强了“吨粮田”建设.通过大力实施土地整理,有效改善了农业生产条件,促进了农业生产发展。
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