发酵床并非完全的懒汉养猪，但肯定比传统养猪要轻松得多，环境也好得多，但绝对不能完全放松管理；
猪舍的布局一定要照顾到通风降温，夏季一定要把通风降温的工作做好，其实无论是发酵床养猪，还是传统养猪，都必须重视的，但发酵床由于有垫料，如果不能合理管理，则垫料发热量大，如果合理管理，则猪的热应激甚至比传统养猪还少。
管理得好的发酵床，疾病极少，之前用过传统养猪的，转到发酵床后，可以明显感觉到这一点但也绝不不做免疫，必须免疫的就得免疫，再根据实际情况，来决定是否在母猪产前做一些细菌性疾病免疫（如副猪、链球菌、喘气病、猪肺疫、传染性胸膜肺炎、传染性胃肠炎和流行性腹泻等）,其他病毒免疫一般是：种猪只做猪瘟\乙脑\伪狂犬\细小病毒等，育肥猪只做猪瘟\伪狂犬。
保持一个良好的半好氧发酵的垫料状态，是技术的关键之一， 半好氧发酵分解速度最稳定、产热量不大（甚至可形成小环境中的空气对流，造成凉爽的感觉，有利于夏季防止热应激）、菌种保持活力高、抑制有害微生物的效果好，菌剂可持续能力强、有利于有益菌保持绝对优势。
控制好垫料的含水量，不定期补充发酵床菌剂，也是关键技术之一，之前总担心垫料过湿，所以，建议少加水，而实践证明，加太少的水，垫料发热量非常大，而水是蓄热的，发酵产生的热量，垫料中的水可以蓄积，从而延缓温度的升高，而且最重要的是，微生物发酵分解粪便活动，需要水份的参与。
所以，操作上要求制作发酵床时，底层和下层需要用水浇透，下层不要怕过湿，注意控制表层水份比较干爽即可。
尽量以锯末为主要垫料原料，这种原料的惰性最强，最不容易发热，也不容易消耗。
同时强烈建议在发酵床养的猪的饲料中添加5～15%的发酵床菌液，可以显著减少粪便中的病原体数量，同时，也增加了发酵床垫料中的有益细菌数量，有利于发酵床保持活力和加快分解粪便。有条件的就多用一点，没条件的少用一点，但最终都有显著的效果。
为了加强粪便的分解和同化成菌体蛋白的作用，建议垫料中加入10～20%的黄玉米秸秆粉（或棉杆粗粉、甘蔗渣、甜菜渣、麦秸秆粗粉、高粱秸粗粉……等农作物秸秆粗粉），以增加垫料中碳源，增强同化粪便中氮源的作用，也可以在补充垫料时添加部分，它们在发酵过程中也会部分变成猪喜欢吃的菌体成分。
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