1、垫料的选择
最重要的是垫料的选择原则：
垫料要有一定惰性，不易被分解，木质素为主的好；
垫料要粗细搭配，不能全部用细锯末，也不能全部用谷壳，既要保证透气性，又要保证吸水性；
垫料要有一定的吸水性能，如一斤混合垫料至少吸附一斤水而不往外淌水，这就要示细料要占有一定比例；
垫料要有一定的硬度或刚性，不至于轻易板结，如稻草就不行；
2、水分：
因为如果垫料太湿，由于水是蓄热量很大的东西，或者说比热相对比较大，发酵好不容易产生的一点热量，如果垫料太湿的话，则都让水蓄积了，温度反而上不去。
表面含水量只是看起来是湿的，手感还是非常干爽的，用嘴吹一下，不扬尘而已，是非常符合我们标准的表面含水量。
3、含氧量：
在分解粪尿的微生物发酵原理中，虽然厌氧发酵和好氧发酵都可以分解粪尿，但以好氧发酵的分解效率高，是厌氧发酵效率的10多倍，所以垫料管理中必须清楚这一点，保持一个相对比较疏松的垫料，能让外界的空气通过对流进入垫料内部，管理上的操作方法为不定期翻料，保持垫料不板结以利于物质交换（判断板结的标准：不论在哪里，取一些垫料块于手中，用手轻搓一下，能散开来，就是不板结）
所以，必须记住这两点： 尽量保持垫料疏松； 尽量不让垫料板结；
4、含菌量：
发酵床菌种主要是分解粪便和少量粗纤维的菌种，垫料消耗较少，而农富乐发酵床菌株基本上不含有分解木质素的菌株，例如土著菌就是从森林腐殖质中分解得到的菌种，这种菌种本来就是分解落叶、腐木的菌种，他们能分解木质素，更不用说分解粗纤维了，而垫料中的锯末、谷壳中就含有大量的木质素和粗纤维，它们大肆吞噬垫料中的可利用碳水化合物，从而产生大量的热量，温度非常高，与此同时，垫料也消耗得非常快，几乎每周都要补充垫料。如果消耗过快，只会增加养殖户的成本和麻烦。
5、规模：
微生物发酵必须要有一定的规模才能发酵得好，面积越大，越容易形成微生态平衡，发酵越是稳定，如果只是用一个塑料桶装一些垫料，加入一些粪便，再加菌种来试验是否可以分解掉这些粪便，这样做是分解不了的，或者说需要非常长的时间才能分解桶中的粪便，建议最少的发酵床面积为10平方米以上。
实际上，即使不加任何菌种，只是把一定数量的垫料，如至少500公斤垫料，加适量水打堆，自然界中存在的微生物，也能让这堆垫料的内部发热产生一定的温度，加入专业的菌种，则只是更为定向地分解粪便，并形成稳定的微生态平衡。
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