不仅动植物的遗体能形成化石，而且表明它们曾经存在过的证据或踪迹也都能形成化石。痕迹化石能提供有关该生物特点的相当多的情况。很多壳、骨、叶以及生物的其它部分，都能以阳模和阴模的形式保存下来。如果一个贝壳在沉积物硬化成岩之前就被压入海底，它的外表特征就会留下压印（阴模）。如果阴模后来又被另外一种物质充填，就形成阳模。阳模能显示出贝壳本来的外部特征。外部阴模显示的是生物体硬部分的外部特征，内部阴模显示的是生物体坚硬部分的内部特征。
简单地说，化石就是生活在遥远的过去的生物的遗体或遗迹变成的石头。在漫长的地质年代里，地球上曾经生活过无数的生物，这些生物死亡之后的遗体或是生活时遗留下来的痕迹，许多都被当时的泥沙掩埋起来。在随后的岁月中，这些生物遗体中的有机质分解殆尽，坚硬的部分如外壳、骨骼、枝叶等与包围在周围的沉积物一起经过石化变成了石头，但是它们原来的形态、结构（甚至一些细微的内部构造）依然保留着；同样，那些生物生活时留下的痕迹也可以这样保留下来。
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朝阳古生物化石博物馆，生物体上的硬组织也能被保存下来。差不多所有的植物和动物都拥有一些硬部分，例如蛤、蚝或蜗牛；脊椎动物的牙和骨头；蟹的外壳和能够变成化石的植物的木质组织。生物体的坚硬部分由于是以能抵抗风化作用和化学作用的物质构成的，所以这类化石分布的较普遍。无脊椎动物例如蛤、蜗牛和珊瑚等的壳是由方解石（碳酸钙）组成的，其中很多没有或几乎没有发生物理变化而被保存下来。
只不过，这些蚊子的近亲非常特别——恐怖虫，在特展中心展示了它的复原图：它的体长不足1厘米，和我们常见的蚊子差不多大；触角很短，具有刺吸式“嘴巴”；没有翅膀，后足上长有一个巨大的螯；而在腹部有着成对的肉质侧叶，就像一根根“肉刺”。
黄迪颖说，过去科学家们怀疑恐怖虫是恐龙身上的寄生虫，和跳蚤是近亲，不过为什么虫子要长螯，全球科学家没人说得清，这种小虫子被称为全球昆虫之谜。
古生物化石，1.65亿年前，恐龙还统治着地球。跟那些庞然大物相比，史前巨型跳蚤体长才2.4厘米，微不足道，但却是现代跳蚤体长的8倍。还有一种叫“恐怖虫”的，虽然体型小，但是长有一对类似螃蟹的大钳子，它生来不为吸血吃肉，一生就为传宗接代……五一期间，这些稀奇古怪的虫子化石，将在南京古生物博物馆公开展出。市民可以前往参观，一睹这些全球科学界著名小虫的神奇风采。
另一些有机物具有几丁质（一种类似于指甲的物质）的外甲，节足动物和其它有机物的几丁质外甲可以成为化石，由于它的化学成分和埋葬的方式，使这种物质以碳的薄膜的形式而保存下来。碳化作用（或蒸馏作用）是生物埋葬之后在缓慢腐烂的过程中发生的，在分解过程中，有机物逐渐失去所含有的气体和液体成分，仅留下碳质薄膜。这种碳化作用和煤的形成过程相同。在许多煤层中可以看到大量的碳化植物化石。在许多地方，植物、鱼和无脊椎动物就是以这种方式保存下它们的化石。有些碳的薄膜精确地记录了这些生物的最精细的结构。
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