据调查，养殖1头牛产生的废水超过22个人生活产生的废水，1头猪产生的污水相当于7个人生活产生的废水。一个万头猪场的污染负荷几乎相当于一个10万～13万人口的城镇。1头猪的日排泄粪尿按6kg计，是人排粪尿量的5倍，年产粪尿约2.5t。如果采用水冲式清粪，1头猪日污水排放量约为30kg。1个千头猪场日排泄粪尿达6t，年排泄粪尿达2500t；采用水冲清粪则日产污水达30t，年排污水l万多吨。对这些粪尿及污染水若不积极开发利用，将会导致环境污染和生态平衡的破坏。据估算，到2020年，全国畜禽粪便的产生量将达到42.44亿t[4]。对这些粪尿及污染水若不积极开发利用，将会导致环境污染和生态平衡的破坏。
1.畜禽粪便造成的污染
根据正常情况下畜禽的粪、尿排放量及其N、P等含量，年饲养一万羽蛋鸡的养鸡场平均每天粪便排放量达1.5t，其中N和P的排放量为24.45kg和23.1kg；一个年出栏一万头猪的养殖场，平均每天粪便排放量达17.5t，其中N和P的排放量分别达105kg和70kg。若粪便中的N、P物质直接排放到环境中会对其造成严重的危害，其中N转变成氨气，释放到空气中，增加空气中氨的浓度，严重时形成酸雨；含磷污水进入江河容易引起藻类和浮游生物的大量繁殖，导致水质恶化和富营养化，进而引起鱼类和其它浮游生物大量死亡。
2.空气污染
畜禽养殖场中检测出的有害气体有100多种[5]。猪、鸡等畜禽饲料中的70%左右的含氮物质未被充分利用被排泄出来。大量的畜禽粪便如不及时处理，在高温下发酵和分解，产生氨气和硫化氢等臭味气体，排放到大气中，会使臭味成倍增加。同时产生的甲基硫醇、二甲基二硫醚、甲硫醚及多种低级脂肪酸等有害气体，对空气造成污染，使空气中含氧量相对下降，导致周围动物及人的免疫力下降，呼吸道疾病频发[6]，同时影响畜禽产品质量。
3. 水体污染
畜禽排泄出大量的废弃物是水体污染的源头。例如，1个千头猪场日排泄粪尿达6t，年排泄粪尿达2500t。采用水冲清粪则日产污水达30t，年排污水1万多t[7]。在养殖过程中，使用清洁的水体冲洗饲养圈内外产生污水，排入沟渠、河流，造成地表水污染或下渗造成地下水污染。清洁水体（如自然降雨、上游流水等）与养殖场的粪便等废弃物发生接触，使清洁水体受到污染，更不容忽视的是通过粪肥归田利用后发生营养物流失，也会导致地表水或地下水污染。
