一般在巴氏菌乳的生产过程中，冷却、离心净乳和巴氏杀菌是必须的阶段。巴氏杀菌的目的首先是杀死引起人类疾病的所有微生物，经巴氏杀菌的产品必须完全没有致病微生物。从杀死微生物的观点来看，牛乳的热处理强度越强越好。但是，强烈的热处理对牛乳外观、味道和营养价值会产生不良后果。如牛乳中的蛋白质在高温下将变性；强烈的加热使牛乳味道改变，首先是出现“蒸煮味”，然后是焦味。因此，时间和温度组合的选择必须考虑到微生物和产品质量两方面，以达到佳效果。
巴氏奶加工设备是专门制作巴氏奶的设备，一整条生产线经过一道道工序加工出新鲜可口的巴氏鲜奶，巴氏奶被称为是“营养”的牛奶，因为巴氏奶加工是利用巴氏杀菌，也就是人们口中所说的“低温杀菌”，这里的低温是指在72－85°C下加热10－20秒，有效消灭牛奶中全部的有害细菌，同时又不破坏营养结构，而高温杀菌是在135—150℃的温度下，进行4秒左右的瞬间灭菌处理，完全破坏其中可生长的微生物和芽孢，将牛奶中的有益和有害微生物全部杀死达到商业无菌的要求，但是高温灭菌会使牛奶的营养成分遭到破坏从而减少了营养，影响口感。
杀菌机特点
1、加热与控温，这个是巴氏消毒的标志性的功能，控温精确与否直接反应的是机器的质量的优劣
2、搅拌与均匀，这个也是必备的功能，因为机器在加热过程中会有粘锅糊底的现象，通过加搅拌均匀后可解决，另外奶浆储存过久，可能会造成沉淀，需搅拌均质。
3、快速冷却，这个是机器的一个衍生功能，但是如果有了制冷，那机器就可可以快速的达到认可一个温度，通过精确的控温，来实现，而且有了制冷的功能就可以节省时间，防止奶浆在高温下变质变味，并易于保存。
