到了六十年代，潘天寿看到国画都是以人物为主，山水和花鸟只是作为人物的背景衬托。他意识到如果把山水和花鸟都变成了人物画的背景，这样山水、花鸟画将得不到发展。因此他提出了要把中国画系里将人物、山水、花鸟三个专业分科的建议，经批示后才得以分科。要不是潘天寿的努力，山水、花鸟画就中断了。 这个时候的潘天寿在指画创作上非常勤奋，一年要画20多幅。他不仅指画创作的多，并且专门写了一本指画著作《指头画谈》，对指画的特点和技法作了精辟的论述，他在书中写道：指头之运墨作线，具有特殊之性能情趣形成特殊风格，非毛笔所能代替。 到了文革时期，潘天寿被关进牛棚监禁达三年之久。 1969年，在被游斗的途中，他在一张香烟壳纸背面写下：“莫此笼絷狭，心如天地宽。是非在罗织，自古有沉冤。” 此后，他重病卧床不起，就在弥留之际他还念念不忘指画，1971年9月15日，潘天寿逝世。 潘天寿一生致力于国画的教学与创作，并著述颇丰，他建立了一套完整的迄今影响zui大的国画教学体系，被称为近代中国画教学的奠基人。
