农产品追溯是一项复杂的系统工程，涉及面广，利益主体多，业务流程也多种多样，要实现农产品的全产业链追溯必须系统考虑，全面推进;而物联网是一项较新的事物，系统运行稳定性还需提高，云计算还需进一步挖掘。因此，农产品追溯和物联网虽都代表着发展趋势，但也都处于探索应用阶段，实现两者的完美结合从而发挥两者的优势更是一项复杂的工程。由于农产品不同种类特性不同、产销不同环节信息化水平也差异较大，在不同环节可选择的具体应用模式多种多样，必须从实际出发，因地制宜地选择适合的信息技术，实现高效追溯和低成本追溯。
从完成农产品追溯的角度看，在农产品追溯的任何一个环节，物联网感知层要解决的问题均是选用最合适的信息技术，以低的成本、最简单的程序采集追溯所需的信息。根据物联网体系架构中感知层的功能定位，农产品追溯体系中感知层应用模式主要包括信息采集内容、信息采集主体、信息采集方式、信息标识方式、信息存储方式等5个方面的具体应用模式
农产品生产环节是最容易产生食品安全问题的环节，由于受小农生产模式所限，我国农产品的生产者众多，信息化水平不高，科学文化素质较低，生产环节也是追溯信息采集难度大的环节。同时，由于农产品追溯主要是链条追溯和批次追溯，批次号便成为生成或锁定追溯链条的检索码，因此，生产环节作为追溯链条的起始端，批次号的生成至关重要。
农产品追溯链条中的流通环节主要包括批发和零售环节，信息采集内容主要是主体信息、交易信息和检验信息
消费者是农产品的终端使用者，农产品追溯系统必须支持消费者通过终端查询机、电话、网络等方式查询所消费农产品完整产业链条的所有追溯信息，可查询到的信息必须准确、全面、及时、完整。如果不能及时查询或查询不到信息，将严重影响消费者对追溯系统的信任度，最终使追溯溢价无法实现。
总体上，无论是物联网还是农产品防伪追溯都是一项复杂的系统工程，将物联网应用于农产品追溯更是复杂多样，涉及主体多、覆盖面广、技术难度大，农产品产销全链条所有主体必须同时推进，政府统一协调，社会加大监督，只有形成合力，才能确保真正将物联网技术应用于农产品追溯，既充分发挥物联网的技术潜能，又充分实现农产品追溯的数据效能。
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