一、计算机软件著作权登记流程为： 填写申请表--→提交申请文件--→缴纳申请费--→登记机构受理申请--→补正申请文件（非必须程序）--→取得登记证书
具体为：
1、填写申请表
在 中国版权保护中心 网站上，首先进行用户注册，然后用户登陆，在线按要求填写申请表后，确认、提交并打印。
2、提交申请文件
申请人或代理人按照要求提交登记申请文件。申请文件包括:软件著作权登记申请表、软件的鉴别材料、申请人身份证明和相关的证明文件各一式一份。
3、缴纳申请费
申请文件符合受理要求时，软件登记机构发出缴费通知，申请人或代理人按照通知要求缴纳费用。
4、登记机构受理申请
申请文件符合受理要求并缴纳申请费的，登记机构在规定的期限内予以受理，并向申请人或代理人发出受理通知书及缴费票据。
5、补正程序
申请文件存在缺陷的，申请人或代理人应在规定期限内补正，逾期不补正的，申请将被视为撤回；经补正仍不符合登记办法的，登记机构将不予登记并书面通知申请人或代理人。
6、获得登记证书
如到登记受理大厅领取证书，应当在受理之日起30个工作日后，持受理通知书原件领取证书。如需邮递的，请在申请表中填写正确的联系地址。
二：软件著作权登记都需要什么材料呢？
1.软件著作权登记申请表
2.用户手册或设计文档
3.源代码（前后30页）
4.企业的营业执照副本
三、 软件著作权登记的益处
1.作为税收减免的重要依据
财政部、国家税务总局《关于贯彻落实〈中共中央、国务院关于加强技术创新，发展高科技，实现产业化的决定〉有关税收问题的通知》规定：“对经过国家版权局注册登记，在销售时一并转让著作权、所有权的计算机软件征收营业税，不征收增值税。”
2．作为法律重点保护的依据
《国务院关于印发鼓励软件产业和集成电路产业发展若干政策的通知》第三十二条规定：“国务院著作权行政管理部门要规范和加强软件著作权登记制度，鼓励软件著作权登记，并依据国家法律对已经登记的软件予以重点保护。”比如：软件版权受到侵权时，对于软件著作权登记证书司法机关可不必经过审查，直接作为有力证据使用；此外也是国家著作权管理机关惩处侵犯软件版权行为的执法依据。
3.作为技术出资入股
《关于以高新技术成果出资入股若干问题的规定》规定：“计算机软件可以作为高新技术出资入股，而且作价的比例可以突破公司法20%的限制达到35%”。甚至有的地方政府规定：“可以100%的软件技术作为出资入股”，但是都要求首先必须取得软件著作权登记。
