内资企业年检就和普通的企业年检程序一样。
外资企业年检：先填写工商部门发的手写版年检书，然后进入当地工商局网站进行网上申报，再进入网站进入全国外资企业联合年检，先填表，上报，待各主管部门审核通过后，打印年检报告书，将年检报告书和各部门需要的资料送到工商局联合年检部门即可。注意：各地的年检程序可能会有所不同，以上为基本程序，建议咨询当地工商部门。首先在外资企业联合年检网上提交全部数据,然后等待审核结果,共有6个部门,等全部审核通过后再打印出报表.
同时在当地的工商网站上提交网上年检,因为是2个独立年检,所以虽然重复了,但还是必须要作.同样等待通过后,打印出报表,其中最重要的就是给联合年检的6个部门盖章的表格.
去提交资料前仔细看过联合年检网上的通知,带其全部证照\财务报表,联合年检报告需要打印6份.
每个部门盖章通过后,最后到工商窗口办理年检,收费50元.
每年1月1日到4月30日（具体年检时间根据当年工商局规定，如2010年的年检时间为3月1日到6月30日），公司得到注册地址所在区的工商分局进行工商营业执照的年检。
具体程序是这样的：先到市工商局网站上，登录到网上年检模块，在网上填写年检报告书，确认无误后，提交网上年检报告书，提交成功后，网上会显示需要公司什么时候、拿什么资料、到什么地址进行现场年检。公司得把网上年检报告书打印出来，然后在相应位置盖公司的财务章、公章、合同章，法定代表处在指定位置签字后，再带着当年的审计报告原件、营业执照正、副本原件到指定的工商分局现场进行年检。工商局设有专门年检办公室，工商局人员审核资料后，如果没有疑义，当时就会在营业执照副本原件上盖年检通过的标记。这样工商年检就大功告成了。
营业执照年检时，工商局一般会关注几个问题：注册资金有没有按期到位 、有没有抽逃注册资金、公司的办公地址是不是和注册地址一致、公司的具体经营业务是不是和营业执照上标明的一致等等。
关于外汇年检：
工商执照年检成完了，千万别觉得没事了，外资公司还得进行外汇年检。一般来讲外汇年检的时间和营业执照年检的时间相似，但具体的时间得和国家外汇管理局北京外汇管理部来确认。
外汇年检的程序与工商年检的程序基本一样，具体程序是这样的：到外汇管理局的网站填写网上年检报告书，确认无误后进行提交，打印出年检报告书，在相应位置盖公司的公章，然后带着当年的审计报告原件、外汇登记证原件到北京外汇管理部现场进行年检。北京外汇管理部审核资料后，当时就会在外汇登记证原件加盖年检通过的标记。这样外汇年检也就大功告成了。
其他年检：
营业执照年检和外汇年检办完了，事情还远远没有结束，还得和市技术监督局确认组织机构代码证年检、海关确认海关登记证年检、出入境管理局确认三资企业备案登记证年检、统计局确认统计证年检。
