鸡摄入的饲料并没有完全消化吸收，约有30%－70%的营养物被排出体外，因此鸡粪在所有禽畜粪便当中养分是高的。鸡粪是一种比较优质的有机肥，其含纯氮、磷（P2O5）、钾（K2O）约为.85%。但鸡粪中含有大量的微生物有害病菌,绝对不能直接施用，直接施在土壤中，会二次发酵产生大量的热量，烧毁作物根系。同时鸡粪本身带有大量病菌，给作物带来病害隐患。因此须将鸡粪进行生物发酵处理和完全腐熟后才能施用于作物。
要使鸡粪更好变为有机肥，最重要的步骤就是要使鸡粪高温发酵。鸡粪要进行深度高温发酵的目的主要是两个，一是杀灭有害病菌，一是将未充分消化的物质进行分解，转化为植物可以吸收的小分子物质。所以，鸡粪在施用前必须经过有机肥发酵剂充分的腐熟，将存在鸡粪中的寄生虫及其卵，以及传染性病菌在腐熟（沤制）的过程中被灭活。
当鸡粪的干度已经到了可以堆起来的时候，把鸡粪堆成一堆，可以在鸡粪堆上盖一层塑料布防止水分过渡流失，然后等待鸡粪自然升温，当鸡粪内部温度升高到70摄氏度左右时，把鸡粪摊开，降温后再重新堆起，这样2-3次后，待鸡粪堆不再升温到50摄氏度以上时，发酵就完成了。如果不翻堆，发酵时间会比较漫长，大致要3个月左右，而且有机肥质量也会有所下降。定期翻堆的话半个月左右就能发酵完成。
