1、建筑企业的分公司可以分成两类：一是因内部管理需要而设立，但并未办理工商登记的分公司，这种内部分公司多与总公司在同一地区；二是异地施工迫于当地要求而办理工商登记的分公司。
2、对于内部分公司，其实质上属于事业部，不具备独立的纳税资格，对外发生经营业务，是以总公司名义开展，也是以总公司的名义开具fp。
在会计核算上一般与总公司分账核算，在编制报表时，需要由总公司进行汇总，通过总公司向税务机关申报纳税。
因此，内部分公司与总公司之间发生业务往来均不涉及任何税收。上交利润或者管理费，一般通过「内部往来」科目核算。
3、对于办理工商登记的分公司而言，一般为独立的增值税纳税人，企业所得税方面，又可分为独立核算的分公司和非独立核算的分公司。
4、总公司与分公司之间发生业务往来，属于增值税征税范围的，应当计算缴纳增值税，如上交管理费、调拨资金、转售材料货物等；不属于增值税征税范围的，不缴纳增值税，如上交利润。
5、独立核算的分公司，独立缴纳企业所得税，以分公司为纳税主体，核算其收入、成本、费用、损失等。向总公司上交的管理费，如符合独立交易原则，凭总公司开具的fp可在分公司税前列支；总公司相应确认企业所得税收入。
如向总公司上交税后利润，则不属于增值税征税范围，可直接通过「利润分配」科目核算，以总公司开具的收据做为会计凭证。
6、非独立核算的分公司，与总公司合并缴纳企业所得税，或者适用总分机构汇总纳税规定，在计算应纳税所得额时，总分公司为一个纳税主体。
分公司向总公司上交的管理费或者利润，无论增值税如何处理，会计上如何核算，均不影响总分公司的应纳税所得额。
