肠毒综合症的危害比较大，它会造成鸡的过料、排西红柿样粪便、尖叫、瘫痪等症状，此病死亡率虽然不高，但会严重影响鸡的生长速度，造成料比高，还可能带来免疫抑制，造成免疫失败，因此往往造成较严重的经济损失。
1、发病初期：有轻微的肠炎，肠壁增厚，颜色变浅，呈灰白色，时而见到一些未消化的饲料，有的肠壁上有针尖大小的红色或灰白色小点，严重的在小肠中后段充满橘黄色的柿子样、鱼肠样或胡萝卜样物质。
2、发病的中后期，肠壁变薄，肠粘膜也脱落，肠内物呈蛋清样、粘脓样或柿子样，治疗难度加大，肠毒在临床当中还有其他的表现：中、后期个别鸡会出现神经兴奋、疯跑，之后瘫软死亡。脱水，爪子发干，羽毛没有光泽，生长速度减缓，鸡冠萎缩等。
