首先，是它不可再生的自然遗传。特别是植物、无脊椎动物、脊椎动物等化石的硅化木，更十分珍贵。第二，是它的科研价值，它是历史的鉴证，研究古地质、古气候的科学依据，从中可知光照长短，雨水多少，经纬和地域变化，地史变迁，植物群落组合等的第一手资料。第三，是它的观赏价值和收藏价值。在木化石的诸多奇石中，以硅化木的质、形、色、纹佳，通、透、漏、皱的比较好，是赏石家珍藏的上品。
藏虫木化石为佳品
当今的木化石市场似乎还不用担心假货的出现：首先，要逼真地制作优质的木化石是殊不容易的；其次，省市级的质检站就完全具备检测木化石材质和造型真假的各种条件。
，可根据适用于观赏石评价的“质（品质）、色（颜色)、形（形状）、纹（花纹）、体（整体造型）”五项价值指标来鉴赏和评价。一般认为，最有价值的应该是带虫化石的木化石，其次是树枝形、树节形、数瘤形的木
化石。自然，能反映出树木种类、树皮、树枝、树节、树瘤、年轮、虫洞、肌理和材质种水的，并能对收藏者个人产生视觉、审美、感性和悟性方面共鸣的木化石，就是好的木化石。