在这些评价腐熟度指标的方法中，比较常用的有碳氮比指标，耗氧速率的测定，NO3- -N和NH4+-N的测定比较快速而简单，而用氢氧化钠溶液吸收堆料产生的CO2气体以确定其产生量的方法经常作为标准的实验室对比试验方法。
但是应用这些评价方法经常会得到不同的结果，这是因为堆肥的腐熟度受很多因素的综合影响，单个指标的评价只能片面地反映某个阻碍因素的作用，不能最直接反映植物的生长特性。
因此，不能用单一的指标评价堆肥的腐熟度。而堆肥产品最终要作为有机肥应用于作物的生产，种子发芽指数是一个很好的生物指标，综合反映了堆肥产品的植物毒性，所以目前较为认同的堆肥腐熟度的评价方法是将化学指标与生物指标结合起来，采用多种分析方法测定多个指标，然后根据这些指标综合分析堆肥的腐熟状况。
美国加利福尼亚堆肥质量委员会(CCQC)建议必须用两项以上的化学/生物指标来评价堆肥的腐熟度。
评价指标由三部分组成：
1.碳氮比；
2.A组测试指标中的至少一项；
3.B组测试指标中的至少一项。
在进行A组和B组的测试之前，C/N的测试必须要达到小于或等于25。
A组测试指标：主要是表征堆肥中有机物质的降解程度，内容有CO2的释放量、氧气的消耗速率和自热产生量。
B组测试指标：主要是表征堆肥产品可能会对植物产生的毒性的一些化学性质，内容有NH4+-N和NO3--N的比例、氨浓度、挥发性有机酸的浓度及种子发芽或植物生长试验。
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