心理咨询室地点的选择应本着安静和方便的原则，尽量避开教学区、学生活动区等热闹场所，去心理咨询室的道路也不应经过学校领导、班主任、学科老师的办公室。
心理咨询室的地点的选择也要避免另一个极端，不能选择太偏僻的地方。如果某一条道路的唯一目的地就是心理咨询室，也会增加来访者的心理负担，因为来访者一般不愿意让同学和老师知道自己在寻求心理咨询。
心理咨询室邻近学校的图书馆、卫生医疗室等场所，这样既安静又便于寻找。
心理咨询室的布局对整个心理咨询的气氛协调是有影响的。布局整齐、协调有助于提高咨询效果。
一般说来，中小学心理咨询室必须具备办公接待区（兼档案区）、团体游戏区、个别辅导区三个区域，三个功能区域也可以单独建室，即设立办公接待室、团体游戏室、个别辅导室（兼具中控督导室功能）。有条件的学校还可以设置心检阅览室、社团生涯室、潜能开发室、中控督导室、艺术放松室、情绪疏导室等区域。如果单独建室，则可称为心理咨询中心。
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