突出企业的技术创新主体地位
多年来，产学研合作一直是形成我国科技与经济“两张皮”现象的核心问题，也是多次科技体制改革的核心内容，但长期以来一直没有得到有效解决。其实，产学研结合的关键是要强化和突出企业的技术创新主体地位，加快建立以企业为主体、市场为导向、产学研用紧密结合的技术创新体系。
目前，国内高校和科研院所谈产学研合作较多，相比之下，企业普遍重视不够。究其原因，主要是我国的企业绝大多数还不具有产学研合作的主导地位和能力，企业还没有真正成为研究开发投入、技术创新活动、创新成果应用的主体，缺乏产学研合作的内在动力和主动权。
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要从根本上解决好产学研合作问题，需要从外部因素（改善市场环境、改进高校和科研院所的评价机制等）和内部因素（增强企业自身技术研发能力）两个方面着手。
从外部因素来看，首先政府须下大力气改善市场环境。必须严格调控虚拟经济和垄断行业的盈利空间，引导更多的资本和人才资源进入到实体经济中来。同时加大知识产权保护力度。导向应该是只有科技创新和商业模式创新才能赚取大幅利润，这样才会引导大量资本到天使投资、风险投资和成长性投资，才会出现科技创新蓬勃发展的大好局面。
同时，必须改进高校和科研院所的评价机制。必须建立健全由企业牵头实施应用性重大科技项目的机制，重点支持和引导创新要素向企业集聚，建立有利于自主创新的政绩评价体系和科研项目评审体系。企业是市场活动最直接的参与者，“春江水暖鸭先知”，对市场信息反应最灵敏，能够从市场需求变化中产生创新灵感和创新意愿。鼓励和支持企业把创造和拥有自主知识产权作为战略导向。对于符合国家战略方向的企业技术创新活动，在政策和投入上给予优先和重点支持。建立有利于自主创新的政绩评价体系和科研项目评审体系，在政绩考评和科研项目评审中，加大对创新、质量和效益等方面的权重，改变目前通行的政绩和项目考核的价值导向。
从内部因素来看，企业必须拥有自己的研发机构（如企业技术中心）和研发人员，并能自主地提出研发要求和具有市场开发能力。
在产学研合作中，突出企业为主体的技术创新地位，并不等于创新链的所有环节都要在企业进行，而是指由企业来主导创新过程，在技术创新课题提出、技术研发投入、成果产业化过程中发挥主体作用。一般来说，科研院所里的科技专家与企业里的专家的目标是不同的。科研院所的科技专家一定要做到技术完美，企业里面的专家则认为只要市场能接受，就可以上市，前者强调技术的先进性，后者强调技术的适用性和投入产出比。同时，高校和科研院所距离市场较远，单靠他们的科技开发能力显然不能满足市场的要求，企业必须提升自己的研发能力和水平。企业的研发主要是解决科技成果的市场转化问题。这就需要科研院所的科技专家和企业的技术人员都要转变观念，各自相向往前走一步： 科研院所的科技专家往“下”走一步，将实验室技术发展为工业技术；企业技术人员往“上”走一步，理解并帮助解决转化过程中的各种问题。只有这样，双方才能形成有效对接的互补协作关系。
产业组织理论认为，企业的某种能力和资源缺口是可以通过三种途径解决的：一是市场购买；二是自主开发；三是合作开发，如产学研合作，或者建立技术创新战略联盟。技术作为企业的重要核心能力和战略资源，其缺口同样可以通过这三种方式加以解决。据OECD 专家的研究，在年十年间，美国、日本和欧洲跨国公司中，外部技术资源占有重要地位的企业，已经从平均不到20%迅速上升到80%以上。就是说，即使是跨国公司这样的企业研发也并非什么都要自己来做，偏重基础研究的部分可以由高校和科研院所来做，产业共性技术部分可以委托专业机构（如工业技术研究院、公共技术研发平台等）来做，甚至部分技术研发业务完全可以外包出去，但自己需要提出技术需求，自己掌握核心技术和关键技术，进行产品开发（即使是市场购买的技术也需要消化吸收的“二次开发”），这里的关键是具备技术集成的自主整合能力。目前政府有一些专项资金支持企业研发，但目前主要还是针对项目来进行，建议今后应主要调整为支持企业研发能力建设（具体可以结合各级企业技术中心认定工作进行）。
