医疗器械许可证可分为三类，其中一类可直接办理，二类zwnj;需要备案办理，办理流程主要是：1、提交网上申请，资料进行审查；2、形式审查有两个结果：项目受理和不予受理；3、通过形式审查；4、等待通知到受理处，领取证件。三类医疗器械许可证办理流程是：1、申请人提交申请资料到食品药品监督管理部门申请经营许可；2、食药监管部门受理申请人申请；3、到实际场地进行勘察以及对产品进行审核；4、准予办法三类医疗许可证。 办理一类，二类，三类医疗器械许可证的区别主要是：一类可以直接办理；二类需要备案办理；三类需要相关部门审核通过后才可办理，且三类医疗器械许可证在办理过程中对场地、人员等方面也有一定的要求。
