香榧还有一种根腐病，在接近地表的根颈部发病，称白绢病，又称菌核性根腐病。在湿润条件下，茎基部产生白色的菌丝体，菌丝逐渐向下延伸，引起根腐。病苗容易拔起，根部皮层已腐烂。
香榧发生根腐病的几个主要原因：
1、土壤。酸性至中性的土壤和砂质土壤容易发病。贫瘠缺肥、黏重板结的土壤中，根系不透气，苗木生长差易发病。
2、环境。土壤湿度大、雨水多发病重，特别是在连续干旱后遇雨会促进菌核萌发，增加对寄主侵染的机会。
3、香榧本身根系特性。香榧根系属肉质根，浅根系，怕涝。如果遇到雨水过大，排涝不及时容易积水涝根，造成根腐。要选择土壤疏松，排水良好的土地作为香榧造林地。香榧的这个特点跟猕猴桃很像，都是肉质根怕涝易根腐。
出现根腐病症状的，用青枯立克+大蒜油+哈茨木霉菌灌根1-2次，小树苗就在根系附近灌，大树在树冠投影外围挖环状沟灌根，以灌透为标准。根腐病的病菌可以通过林木根部的相互接触而传染蔓延，因此病树周围看似健康的树也要照病树方案用药。对于小树苗出现根腐的，除了灌根外，需叶面喷雾靓果安+沃丰素/氨基酸类叶面肥，给树体补充营养，叶面吸收营养比根系快，降低根腐病的死亡率。
追肥或基肥时候施用土壤调理剂-奥农乐，增加土壤有机质含量。奥农乐内含多种有益菌群，菌量大，活性高，能疏松土壤，提高土壤的透气性。奥农乐内含的麦饭石，可为香榧生长提供多种矿质元素，提高植株的抗逆能力。
要定植的小苗，定植后用青枯立克+地力旺灌根，杀菌、促进伤口愈合，促生根。运输后的苗木，多因挤压摩擦而受伤，容易感病。
