鸡已感染病毒接种时鸡体内已匿伏有强毒病原微生物，仅仅未表现明显的临诊症状，或接种人员和接种用具带有强毒病原微生物。
接种时刻不适宜养殖户难以确定接种疫苗的准确时刻，其免疫作用也就存在不确切的或许性。假如接种的时刻过早，则会中和雏鸡体内的母源抗体，被中和的这些鸡疫苗就起不到免疫作用；若疫苗接种的时刻过晚，因雏鸡体内母源抗体水平低，则或许在接种前已被病毒感染而发病。
疫苗选用不当而引发疾病例如，雏鸡大剂量运用新城疫Ⅰ系疫苗会导致扭头、转圈等神经症状，大剂量运用传染性喉气管炎疫苗会呈现流泪、喉头出血等传染性喉气管炎症状。
鸡接种疫苗后引起不良反应例如，鸡新城疫Ⅰ系疫苗、鸡传染性支气管炎疫苗、甘保罗病疫苗的接种，或许形成本来不明显的败血性霉浆体病的爆发。因此，当鸡群中在鸡霉浆体病匿伏又要进行上述疫苗接种时。
疫苗运用技术错误近年来常用的法氏囊灭活疫苗的运用方法一般有两种：一种是混在水里通过饮水进行接种，另一种是通过滴服法进行接种。有些养鸡户将两种方法混为一谈，往往图省劲，把本来应该滴服接种的疫苗改为饮水接种，因其运用方法不当导致免疫失利。其他，有的养鸡户尽管运用饮水接种疫苗的方法正确，但因运用的自来水带有消毒，或许运用金属类饮水器，或许停水时刻不当，或许疫苗饮水时刻过长（逾越两小时）等，形成疫苗效价下降，然后影响了免疫作用。
不同种类疫苗间的彼此烦扰作用一个养鸡场或许不止进行一种疫苗的免疫接种，往往几种疫苗一起运用。例如，有的养鸡户一起给鸡接种鸡新城疫Ⅰ系疫苗和鸡痘疫苗。因为鸡新城疫Ⅰ系苗具有很强的烦扰作用，可导致鸡痘疫苗免疫失利，然后有或许发作鸡痘。其他对的传染病，为了确保免疫作用，独自接种，以便产生很强的免疫力。
