国家秘密载体销毁需要以下程序，机关单位与企业秘密文件销毁程序可参照执行：
1、销毁秘密载体,必须要履行清点、登记手续,经机关、单位的主管领导批准,严禁私自销毁。
2、销毁时要确保秘密载体的内容无法还原。销毁磁介质、光盘等秘密载体,应当彻底销毁,必要时采取粉碎、烧毁或化学腐蚀等方式进行。
3、销毁秘密载体时,应当有有关人员在场监销,并由监销人员和销毁人员共同签名,禁止将秘密载体当作废品出售。
4、秘密载体必须送保密工作部指定的单位销毁。（一般单位或企业没有指定的单位，确保执行以上三点即可）
销毁
1、销毁秘密载体，应当经本单位主管领导审核批准，并履行清点、登记手续。
2、销毁秘密载体，应当确保秘密信息无法还原。
销毁纸介质秘密载体，必须使用符合保密要求的碎纸机销毁；送造纸厂销毁的，应当送保密工作部门指定的厂家销毁，并由二人以上押运和监销。
3、销毁磁介质、光盘等秘密载体，应当采用物理或化学的方法彻底销毁。
4、禁止将秘密载体作为废品出售。
5、用于记录秘密载体收发、使用、清退。销毁的登记簿，必须由保密员妥善保管。
