当前，严重影响禽类生产的呼吸道疾病主要有非典型鸡新城疫、禽流感、传染性喉气管炎、大肠杆菌病以及支原体病等。这些疾病发生时，往往不是单一发生，而以多病原混合感染形式出现，给疾病的诊断带来了极大的麻烦，并造成严重的经济损失。
非典型新城疫
非典型鸡新城疫主要发生于已经做了鸡新城疫免疫但抗体水平不高或不均衡的鸡群，有新城疫母源抗体的雏鸡群和常有本病发生而饲养管理水平较差的鸡场。该病一年四季均可发生，在冬、春季常见，临床症状和病理变化差异很大。
临床常见以呼吸道症状为主，病鸡呼吸困难，张口伸颈，发出“咕噜”声；产蛋鸡产蛋量下降，蛋品质下降，种蛋孵化率下降；有些病鸡排出黄绿色粪便，常有零星死亡；有些病程长的病鸡有歪头、扭颈、角弓反张等神经症状。鸡群精神状况不佳、生长发育迟滞。病变主要是喉头、气管充血、出血，粘液增多，少量病鸡的腺胃粘膜、乳头有少量出血点以及肌胃角质膜下有出血斑。小肠呈卡他性炎症，有时肠粘膜出血，盲肠扁桃体肿胀、出血，泄殖腔粘膜充血、出血，但这些典型的病变较为少见，一般呈非典型病变。
以弱毒疫苗进行基础免疫后再用油乳剂灭活疫苗进行加强免疫可获得较好的免疫效果，但要根据本场实际制订合理的免疫程序并且切实加强饲养管理。
大肠杆菌病
本病主要发生在集约化养禽场，各种禽类不分品种、性别、日龄均对本菌易感。特别是幼龄禽类发病多，如处于污秽、拥挤、潮湿、通风不良的环境，过冷过热或温差很大，有毒有害气体长期存在，饲养管理失调，营养不良(特别是维生素的缺乏)以及病原微生物(如支原体及病毒)感染所造成的应激等均可促使本病的发生。
临床常见症状有：
鸡胚和雏鸡早期死亡
该病型主要通过垂直传染，病雏突然死亡或表现软弱、发抖、昏睡、腹胀、畏寒聚堆、下痢(白色或黄绿色)，个别有神经症状。
急性败血症
本病常引起幼雏或成禽急性死亡。特征性病变是肝脏呈绿色和胸肌充血，肝脏边缘钝圆，外有纤维素性白色包膜。
气囊病
气囊病主要发生于3-12周龄幼禽，特别3-8周龄肉仔鸡及肉鸭多见。
心包炎
