首先将生化池注入一定量的清水和部分待处理的污水，然后将污泥倒入物料化制池。一般第1次投加20m3污泥，同时投加大粪等培养料，加水搅拌后按比例均匀 投加到各生化池内。
投加培养料以生化池COD的质量浓度控制在300mg/L为准。然后按比例补加普钙（由于投加大粪无需补加氮源）。
闷曝：投料后进行闷曝。水气体积控制在1：（5~10）。第1天曝气采取6h充氧，4h停机的方式进行。
再次投料：经过1d闷曝后，第2天COD的质量浓度降至100mg/L左右。需再次投料，第2次可投入10~15 m3污泥至化料池，（留下部分作为备用）。
同时投加以大粪为主的培养料，投加培养料仍以控制生化池COD的质量浓度在200~300mg/L为标准。根据 需要补磷后闷曝。
闷曝：第二、三天的闷曝可减少停机时间，生化曝气可控制为开6停2。
经过2~3d的闷曝后，通过显微镜镜检，可能会看到少量的原生动物。原则上，此时每天定时补加碳源逐步以地脚面粉为主。同时投加普钙和尿素，以补充磷源和氮源。补充碳源的标准仍以生化池COD的质量浓度在200mg/L左右为准。
此阶段为排除生化代谢物，生化池需适量换水，同时继续进行闷曝。此阶段为加速污泥菌胶团的形成，在生化池中可适量投加粉状PAM。
后期（7~10d）
一般经过7~10d闷曝，生化污泥表现显淡黄色，污泥30min沉降比达到10%左右。通过镜检可发现有较多活跃的原生动物钟虫、纤毛虫，以及后生动物轮虫、线虫等，此时生化污水处理即可进入驯化及增负荷调试阶段。
增负荷调试一般以每2d增加五分之一的污水负荷进行。1周后基本可以全负荷运行。为平稳过度，增负荷全几天视具体情况可适量补充些地脚面粉作为碳源。
调试条件控制
生化调试期间，曝气强度原则上应结合水中溶解氧类控制气水比，一般好氧区溶解氧的质量浓度控制在1~3mg/L，兼氧区控制在0~0.5mg/L。
其它监控指标主要有COD，生物相、pH值、污泥沉降比。取样分析频率为调试初期一般4h取1次样，中期6h取1次，后期8h取1次样。
