设计施工
洁净室通常用于对环境要求较高、工业流程复杂的高科技行业，以及对人民群众的生命健康造成威胁的医疗卫生和食品行业。在洁净室受控空间中，偶尔有一个大分子的出现，或者是一个细菌的产生都会对成品率和人民的生命健康造成巨大的影响。如一个细菌如果得不到及时的处理，则可能在几个小时之内就会形成一个大的菌落；而大粒子的出现则有可能造成一批次产品的报废，严重的情况下甚至导致洁净室的报废。而在气流组织中，如果人员或半成品的流动造成了对洁净室气流的特殊扰动，就会打破洁净室内部气流平衡，引发各洁净区域之间气流的串扰，造成难以估量的损失。
高级别洁净室的建造费用很高，一般来说，优于 级（FS 209）单向流的洁净室，其室内装修（墙、顶、地、门、窗等）和空调净化系统（包括制冷空调设备和管道配件、净化设备和配件等）的初投资大约为人民币 1元 /m2。如果加上纯水制备设备和系统管道，纯气发生和系统管道，废水治理设备和管道，消防系统，供配电和自控系统，真空清扫系统，等等，其单位面积的建造投资费用高达 25000~3元 /m2。如此高的建造费用，也未必保证洁净室的百分百合格，在庞大的洁净室系统和洁净环境的设计和施工过程中，潜在的问题多，未能受控的污染源，譬如少量的微粒、轻微的气流扰动、微小的震动都会导致整个洁净室的环境失控。洁净室需经过空态、静态和动态的验收，任何一个环节都可能存在风险，同时，在工厂正式运作后，洁净室出现问题的可能也很大。因此，洁净室工程行业企业面临巨大的技术风险，以及后续洁净室运行、维护和调试、检测的压力。
高端市场的竞争主要集中在设计创新、技术水平、工程整合、运营维护等方面服务能力的竞争，主要是以洁净室工程的价值提供作为衡量施工方选择的关键指标，促使洁净室工程行业企业向以价值为竞争导向的技术积累和经营方式转变。在低端市场，洁净室要求不高，大量工程企业参与竞争，导致市场竞争以价格战为主，利润率低。一般来说，对洁净室要求较高的是芯片生产、平板显示器件制造、太阳能电池板和LED照明产品制造等电产品的生产和制造；其次是医药卫生行业对洁净室菌落控制的要求也对洁净室提出了较高的要求；再次是食品、化妆品、石化等领域对洁净室的要求；另外，航空航天、精密机械加工对洁净室也有相对特殊的要求。
