水华的发生伴随着藻类的大量爆发，有效去除藻类是控制水华规模、减 少水华危害的直接途径。经长期的研究与实践，形成了以物理、化学、生物 为手段的三类主要除藻技术。
物理法可以分为去除法和灭杀法，前者是通过一定的物理方法直接去除 藻细胞或降低其含量，主要包括引水换水、机械除藻、过滤除藻、气浮除藻 和活性炭吸附等；后者是使用物理手段直接或间接杀死水体中的藻，主要方 法有遮光处理、电解除藻、紫外线照射和超声波处理等。物理法能够有效去 除藻类，不会产生二次污染，但需要昂贵的费用，所以只能用于小水体和大 水体的局部水域。
化学法主要是化学灭杀法。化学灭杀法一般是通过投加药剂，抑制藻细 胞的生理功能，破坏藻细胞的结构，使藻细胞灭活甚至解体，从而达到杀死 藻类。主要药剂有强氧化剂(液氯、过氧化氢、臭氧、高锰酸钾等)、硫酸 铜等。化学法除藻效果好、成本低，但专一性差，且二次污染严重。
生物法除藻指利用微生物、植物和动物控制藻类。微生物法是通过投加 微生物降解水中营养物质，或投加噬藻微生物直接降解藻细胞。植物法是人 工栽种水生高等植物，对水体营养盐进行控制；另一方面是通过植物释放的 化感物质来抑制水体中的藻类。动物法通常是放养水生动物如滤食性鱼类， 来吞食水体中的藻类。生物除藻的生态安全性高、成本低，但往往见效慢、 作用周期长，其中微生物噬藻虽见效快，但生态安全性有待商榷。
当然，除了上述三种除藻方法，还存在物理化学方法。物理化学方法主 要采取絮凝沉淀、加药气浮等措施。絮凝沉淀法是目前应用最广泛的水处理 方法之一，指在絮凝剂的作用下，使水中的胶体和藻体凝聚成絮凝体、沉淀 沉降，然后予以分离去除。除藻常用的絮凝剂一般有无机高分子絮凝剂(天 然黏土、铝盐、铁盐、聚合氯化铝等)、有机高分子絮凝剂(壳聚糖、改性 淀粉等)、微生物絮凝剂。铝盐和铁盐无机絮凝剂絮凝性能受水体的pH影响 较大。聚合氯化铝对藻细胞有较好的絮凝效果，铝易生物富集，次生危害严 重；铁盐易增加水体色度。微生物絮凝剂具高效、无毒、易生物降解等独特 的优点，但目前大多处于菌种的筛选阶段，且成本很高，无法适应于工业化 生产的需要。
较为典型的絮凝剂为天然黏土絮凝除藻，利用天然黏土可以与藻细胞结 合并形成絮体沉降至水体底部，在这个过程中或直接杀死藻细胞、或吸附营 养盐、或影响其光合作用使藻细胞失去耐以生长的条件等间接除藻。天然黏 土矿物除藻在成本、对环境和非赤潮或水华生物影响等方面优于其他除藻方 法，但因溶胶性质差，迅速凝聚、沉淀藻类的能力低，需大量撒播，给大面 积治理藻类污染带来原料和淤渣量过大的问题。
相对于天然黏土絮凝剂，改性黏土絮凝除藻效果更好，改性黏土絮凝除 藻以天然黏土矿物为基础，对其进行各种改性，以提高黏土絮凝除藻的能力。 是使用壳聚糖对黏土进行包覆改性，目的是利用壳聚糖改变黏土颗粒表面特 性和电性，提高黏土絮凝去除藻细胞的能力。改性和复合黏土除藻能显著提 高黏土的除藻效率且降低黏土的用量，但是改性后的黏土通常会给环境产生 一些有毒有害的物质。
现有技术中较为成熟的改性黏土絮凝剂是使用壳聚糖对黏土(或高岭 土、膨润土等)进行包覆改性，目的是利用壳聚糖改变黏土颗粒表面特性和 电性，提高黏土絮凝去除藻细胞的能力。壳聚糖具有高分子聚合物特有的粘 结、架桥、絮凝作用，而且由于其分子链上分布着大量的游离氨基，在溶液 中可质子化，从而使其分子链带上大量的正电荷。壳聚糖分子链上的阳离子 活性基团可与带负电荷的藻细胞相互吸引，中和并降低藻细胞的表面负电 荷，同时压缩了藻细胞的扩散层而使藻细胞脱稳凝聚，并借助于壳聚糖高分 子链的粘结架桥作用而絮凝沉降。经过壳聚糖包覆改性后的黏土，既能通过 壳聚糖的粘结架桥作用絮凝藻细胞，又能通过其表面电性的改变，凝聚带负 电的藻细胞，同时具有了粘结架桥和电中和双重作用，使黏土絮凝除藻的能 力大幅度提高。
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