一般分子生物学实验室常分为生化实验室与分子实验室，分子生物学是从研究生物大分子的结构发展起来的，现在更多的仍是研究生物大分子的结构与功能的关系、以及调控等方面的机制问题,以生物化学、细胞生物学、遗传学等学科的知识为基础。
生化实验室建设方案
主要是对化学生物进行科学研究，因为里面有很多化学试剂，对人体的危害是较大的，所以一般的生化实验室是需要有排风系统的，可以将实验中所产生的有害气体排放到室外，保证室内的空气不会对人体产生影响，对于三废的处理不能随意，按照相关的环保要求进行处理。
室内设施的基本要求：一般设生化室、药品仪器室、办公室，室内应根据其功能的要求设置给排水、通风系统、电源插座和总电源控制开关，并安装漏电保护器。实验台、通风柜要求水、电到位，设有220V 的二孔、三孔插座各二个以上，实验员办公室不得设在化学实验室内。
药品仪器室：防火、防潮等设施、有单独的危险品存放处，有防护设备和急救箱，室内设有通风换气装置，在仪器的上方一般要求有万向抽气罩或者原子吸收罩，在使用仪器进行实验操作时，可将废气排放到室外，面药品柜的顶部可装有排气系统。
实验室家具：外观整洁，柜内的水管不外露，台面可装有水龙头及PP水槽、洗眼器、滴水架等，还应有电源保护装置，尺寸要求一致，色彩搭配美观，符合科学、实用化，台面及柜体应保持整洁。
分子生物实验室建设方案
分子生物研究和实验的常规方法，并没有严格的净化要求，但是为了避免各个实验区域间交叉污染的可能性，宜采用全送全排式气流组织形式。同时控制送、排风的比例以保证各实验区的压力要求。
试剂贮存和准备区：主要是作为贮存试剂的制备、试剂的分装和主反应混合液的制备，试剂和用于标本制作的材料应直接运送至该区，不得经过其它区域。试剂原材料需贮存在本区内，并在本区内制备成所需的贮存试剂。对气流压力的控制，本区并没有严格的要求。
标本制备区：作为临床标本的保存、核酸（RNA、DNA）提取、贮存及其加入至扩增反应管和测定RNA时DNA的合成。其压力梯度要求为相对于临近区域为正压，以避免从邻近区域进入本区的气溶胶污染。另外，由于在加样操作中可能会发生气溶胶所致的污染，所以应避免在本区域内不必要的走动。
扩增反应混合物配制和扩增区：主要是DNA扩增，已制备的DNA模板和合成的DNA和主反应混合液，制备成反应混合液等，也可以在本区域内进行。在PCR测定中，通常在扩增后须打开反应管。因此扩增有较高的污染危险性，因此本区的压力梯度要求为，相对于邻近区域为负压，以避免气溶胶从本区域漏出。
扩增产物分析区：主要进行的操作为扩增片段的测定，如使用全自动封闭分析仪器检测，此区域可不设。应注意扩增产物污染来源，因此对本区的压力梯度的要求为，相对于临近区域为负压，以避免扩增产物从本区域扩散至其它区域。
实验室配套设施：是保证实验工作的必要条件，根据各个实验室实验内容的不同配备相应的设备和仪器，如超净工作台、生物柜、离心机、加样器等。
