食品中的大肠杆菌一般可用加热杀菌技术、辐射杀菌技术、化学药剂杀菌技术、过滤除菌法以及加热与其他手段相结合的杀菌技术等进行杀灭。
几种大肠杆菌杀灭方式的比较：
1、加热杀菌 巴氏杀菌法：加热杀菌方法，由于所需时间长，生产过程不连续，长时间受热容易使某些热敏成分变化，杀菌也不够理想，目前在大中型食品厂中已很少采用。
2、微波杀菌：微波灭菌缺点是，灭菌不均匀不同的食品材料存在不同的差异，对人体有害，会对耐热性低的器官造成损伤，杀菌过程对包装会产生爆袋的影响，还能使产品变色。
3、紫外线杀菌：紫外线会对人体的皮肤、眼睛以及免疫系统等造成伤害甚至引起癌变，紫外线灯还有一个弊端，有效辐照距离为1.5米，开启时空气中大部分细菌、病毒只是暂时击晕，并未完全杀死；关闭时，待人、物流动后被击晕的细菌、病毒会反弹，使空气浮游菌数量更高。在静态（无人）的状态下使用，对器具、设备有氧化、腐蚀作用。
4、臭氧杀菌：不稳定，易挥发，设备采购、维护有成本，会受温湿度的影响，对大多微生物效果理想，但对真菌作用效果不理想，比如，霉菌。对人体有害，由于臭氧会造成人的神经中毒、引发支气管炎和肺气肿等危害，建议消毒后将门窗敞开2-3小时臭氧散尽后，人员再进入车间。
5、食品级过氧化氢： 新一代的食品级过氧化氢灭菌方法，具有其他产品不具备的优势，食品级过氧化氢的杀菌原理利用极强的氧化能力，其中的活性氧能够破坏微生物体内的原生质，从而达到消灭食品中微生物目的。
有关食品杀菌消毒技术人士建议使用欧洲原装进口的食品级过氧化氢灭菌产品--诺福，诺福基于欧洲原装食品级H2O2+活性胶质银离子的氧化灭菌原理杀菌高效并且无残留。据了解，诺福拥有丰富的成功经验，为国内上千家食品生产企业解决了微生物超标问题，诺福技术成熟、使用方便， 杀菌谱广，杀菌快，作用时间长，腐蚀性小的特点已经广泛应用于食品杀菌行业。
