朱耷的画在当时影响并不大，传其法者仅牛石慧和万个等人，但对后世绘画影响是深远的，他的艺术成就主要一点，不落常套，自有创造。他的大写意，不同于徐渭，徐渭奔放而能放，朱耷严整而能放。清代中期的“杨州八怪”，晚期的“海派”以及现代的齐白石，张大千、潘天寿、李苦禅等巨匠，莫不受其熏陶。
他的作品往往以象征手法抒写心意，如画鱼、鸭、鸟等，皆以白眼向天，充满倔强之气。是朱耷自我心态的写照。
画山水，多取荒寒萧疏之景，剩山残水，仰塞之情溢于纸素，可谓“墨点无多泪点多，山河仍为旧山河”，“想见时人解图画，一峰还写宋山河”，可见朱耷寄情于画，以书画表达对旧王朝的眷恋。
朱耷笔墨特点以放任恣纵见长，苍劲圆秀，清逸横生，不论大幅或小品，都有浑朴酣畅又明朗秀健的风神。章法结构不落俗套，在不完整中求完整。朱耷的绘画对后世影响极大。
朱耷擅花鸟、山水，其花鸟承袭陈淳、徐渭写意花鸟画的传统。发展为阔笔大写意画法，其特点是通过象征寓意的手法，并对所画的花鸟、鱼虫进行夸张，以其奇特的形象和简练的造型，使画中形象突出，主题鲜明，甚至将鸟、鱼的眼睛画成“白眼向人”，以此来表现自己孤傲不群、愤世嫉俗的性格，从而创造了一种前所未有的花鸟造型。
2019年朱耷字画相关拍卖记录（Artron数据）：
朱耷 山水 立轴---估价:200.00到300.00万---拍卖日期:2019年4月24日
朱耷 1650年作 芭蕉---估价:180.00到280.00万---拍卖日期:2019年6月5日
朱耷 花鸟---估价:380.00到380.00万---拍卖日期:2019年7月21日
朱耷 花鸟---估价:380.00到380.00万---拍卖日期:2019年7月21日
朱耷 枯木兰竹小鸟 立轴---估价:400.00到500.00万---拍卖日期:2019年7月13日
朱耷（八大山人） 芙蓉芦---估价到1800.00万---拍卖日期:2019年4月1日
朱耷 1650年作 芭蕉---估价:180.00到280.00万---拍卖日期:2019年6月5日
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