为保证毛肠求购肠衣的性能，胶原蛋白肠衣需保存在阴凉、清洁、干燥、远离蒸汽管道及锅炉以及避光的地方，为保证延长肠衣的使用寿命，肠衣保存的较佳条件是温度5～15℃，相对湿度在60％～70％。如肠衣曾经在不合适的环境下放置了很长时间，使肠衣干燥，容易爆裂，可将开盒的肠衣打开放置在湿度很大的冷库(0℃ 以上)内一个晚上，即可解决问题。
肠衣密封放在干燥、通风、暗凉处，保质期均为一年以上。使用时如发现肠衣太干，可将肠衣在相对湿度85％左右的环境中放置48h或将肠衣放在常温水中浸泡3～5min即可使用。
肠衣在使用后，尽量将开盒后的肠衣用塑料袋再包装一下。先购进的肠衣先使用，肠衣的包装箱上也有肠衣的生产日期。肠衣对于腊肠的肉质的保存是非常重要的，虽然肠衣有阻隔性，但是还是得进行保存，保证香肠的香气，而且不能变质。
那肠衣如何保存？肠衣的存放得保证在25℃以下干燥、通风、避光处贮存。肠衣在高温、潮湿的条件下贮存会使香肠变形、收缩率下降、规格发生变化。导致变质。所以得存放在干燥，通风的地方存储。而且肠衣通常保存时间只有三个月。
平常我们买的腊肠，尽量放在冰箱冷藏，防止变质，存放的时候可以超三个月。如果在常温下保存，就尽量在到期日期前吃完。
