随着生活水平的提高，人们对水质的要求也越来越高。对水质要求的提高与水源被污染的矛盾日益加剧促进了水处理技术的进步。次氯酸钠因为以上一些优势被广泛用做城市污水处理厂深度处理工艺中的消毒药剂。对于难生物降解或者对生物有毒有害的物质，次氯酸钠较生物处理方法显示出了它独特的优势。次氯酸钠不仅可以迅速灭活二级出水中的粪大肠菌群等细菌，而且对于有着稳定化学结构的难降解有机污染物也可以表现出较好的氧化效果。次氯酸钠在水溶液中可以水解产生HOCI，HOCI不仅可以与-c=c-作用，而且对苯环具有较强的破坏力；同时可以氧化铁、锰等无机金属成色离子，而水中色度一般认为是由-c=c-、苯环物质及金属离子等引起的，因而次氯酸钠具有良好的脱色能力。
采用次氯酸钠作为深度处理工艺中的消毒药剂，可以提高ss、TP、色度以及有机污染物的去除率，同时还可以降低消毒副产物生成的可能性。同时，次氯酸钠与深度处理工艺中的混凝剂相互作用，相互促进，可以减小彼此的投加量而达到最优的效果。因此，次氯酸钠以其很强的氧化能力而广泛用于污水处理厂尾水消毒中。
城市污水处理厂一般采用工业级的次氯酸钠溶液，即有效氯含量在10%左右。工业上制备次氯酸钠一般采用液碱氯化法。将一定量的液碱加入适量的水，配成30%以下的氢氧化钠溶液，在35℃以下通入氯气进行反应，待反应溶液中次氯酸钠含量达到一定浓度时，制得次氯酸钠成品。化学方程式为：
2NaOH+Cl2-NaClO+NaCl+H20
因此，工业制备的次氯酸钠溶液里面会掺有少量的液氯和氢氧化钠。
在污水处理厂中，次氯酸钠消毒可能存在如下问题：
( 1)次氯酸钠消毒液的投加量问题。在深度处理投加次氯酸钠消毒液消毒时，虽然可以通过该水厂日处理量以及次氯酸钠的有效氯含量来估算出消毒液的投加量，但是由于消毒液中次氯酸的含量、原水酸碱度的变化很不易掌控，所以通过烧杯试验估算出来的消毒液的投加量仅仅只能作为参考值，实际投加量要通过大量的试验以及实际运行经验来确定（如本研究采用的是余氯含量来确定消毒液投加量是否合适）；
(2)次氯酸钠消毒液不宜久存。次氯酸钠在水中水解产生的HOCl是起消毒作用的物质，而长久储存次氯酸钠会使得HOC1逐渐分解而失去消毒的作用，同时碱度也会逐渐降低。若是现场制各次氯酸钠，若次氯酸钠发生器稍出事故，必然会影响到深度处理的效果；
( 3)需要增加次氯酸钠消毒液投加设施。因为次氯酸钠消毒液不适合与混凝剂同时混合在一起同时投加，所以需要额外增设消毒液的投加设施，这样一来便增加了运用和维护的工作量。
