柴油滤清器的结构大致与机油滤清器相同，有可换式和旋装式两种。但其承受的工作压力和耐油温要求较机油滤清器低得多，而其过滤效率的要求却比机油滤清器高得多。柴油滤清器的滤芯多采用滤纸，也有采用毛毡或高分子材料的。
柴油滤清器又可以分为柴油水分离器，柴油精滤器。油水分离器的重要功能就是分离柴油中的水。水的存在对于柴油机供油系统危害极大，锈蚀、磨损、卡死甚至会恶化柴油的燃烧过程。由于中国柴油中的含硫量较高，在燃烧发生时，甚至会和水反应生成硫酸腐蚀发动机部件。传统的除水方式主要是沉淀，通过漏斗结构。国三以上排放的发动机对水分离提出更高的要求，高的要求就需要采用高性能的过滤介质。 柴油精滤器是用来过滤柴油中细小的颗粒，在国三以上排放的柴油发动机主要是针对3－5微米颗粒的过滤效率。
燃油滤清器是耗材，在车辆使用过程中，需要定期的更换维护，否则会起不到合格的保护作用。汽车建议每行驶20000公里左右更换一次燃油滤清器。更换方法：准备螺丝刀、千斤顶。
操作步骤：
1、把车停在一个坚固的平面上。
2、降低燃油系统的气压（松开气门盖以降低燃油系统气压 ）。
3、开启引擎直到管道中的汽油用完发动机停止。
4、燃油滤清器的位置一般在引擎下面或油箱下面。如果必要的话，可以使用千斤顶抬升汽车，并从燃油滤清器断开输油管。
5、移除燃油滤清器的安装螺栓，然后就可以拆除燃油滤清器。
6、对比新的燃油滤清器是否和拆下来的型号一致，确认后安装新的燃油滤清器，注意方向确保其指向发动机，确认后就可以安装滤清器固定螺栓。
7、接上输油管并安装燃油泵保险丝。
8、重新连接电池盒，完成后就可以放低汽车。
燃油滤清器的更换周期应根据其自身的结构、性能和用途等的不同而有所差异，并不能一概而论。大多数汽车制造商对其外部滤清器正常维护的更换周期为4.8万km；保守维护的更换周期为1.92-2.4万km。如果拿不准，请翻阅车主手册找出正确的更换周期。
