目前一体化泵站的智能化程度越来越高，因此对它的系统保护也有着非常高的要求，目前使用多的就是微机保护装置，因为它在动作速度、动作正确率及运行可靠性和易用性等方面取得了令人瞩目的成绩。它的工作模式其实很简单，就是从网上获取电力系统运行和故障的任何信息和数据，也可将它所获得的被保护元件的任何信息和数据传送给网络控制中心或任一终端。因此，每个微机保护装置不但可完成继电保护功能，而且在无故障正常运行情况下还可完成测量、控制、数据通信功能，亦即实现保护、控制、测量、数据通信一体化。微机保护的运用使得一体化泵站的继电保护和综合自动化紧密的结合到了一起，它让资源实现了共享，并且还实现了远程控制和信息的共享，终将泵站的控制、信号、测量、计费等回路纳入计算机系统，取代传统的控制保护屏，能够大的降低泵站的占地面积和设备投资。
智能控制实现一体化虽然好，但我们也不能忽视了它目前的一些不足之处，具体表现情况如下：
1、生产厂家跟不上技术的更新速度
虽然一体化泵站的技术发展已经取得了一定的成就，但由于推广力度的限制，以及人的固有思想，使得现在依然有很多生产厂家在沿用传统的生产技术和配置方案。
2、设计标准及规范不统一
当前不同厂家的设备和系统往往使用不同的网络、通信协议和信息描述方法，由于没有一个统一的网络和系统标准，导致泵站自动化系统中不同厂家设备之间无法进行互操作。使用种类繁多的协议转换器进行转换，才能集成为一个系统。这种情况在国内外普遍存在。协议转换器的存在，使得系统集成周期长、系统集成费用高、系统可靠性降低、后期维护不方便。例如继电保护涉及模型较多，厂家模型灵活配置，国内目前尚无统一标准。各个厂家均声称自己符合标准的扩展规范，在国家没有相应的模型管理控制机制的情况下，这种扩展的随意化和去标准化越来越明显。
3、管理模式跟不上技术发展
盐城污水一体化提升泵站 雨水一体化提升泵站
要想做好一体化泵站的自动化智能管理系统，就精通保护、通信、远程控制、调节方式、自动化等各个业，并且还要能够将它们进行有效的结合在一起，使其成为一个整体，而传统的分工生产已经不适合当前的发展技术。如果在生产过程中有一个环节出现错误，那么整个系统都将存在缺陷，因此技术和管理体系的完整是的。
