公司注销了网站备案会被注销吗？会，但不会被立马注销掉，你可以选择主动注销网站备案号，不然在管局不定期备案核查的时候，查到你的公司已经不存在，属于空壳网站，也会主动取消你的备案号。
原则上来说，假如网站停止运营，或转让他人，则需要提前申请注销域名备案。
《非经营性互联网信息服务备案管理办法》 （原信息产业部令第叁叁号）第十五条规定：非经营性互联网信息服务提供者在备案有效期内需要终止提供服务的，应当在服务终止之日登陆信息产业部备案系统向原备案机关履行备案注销手续。
对于主动注销域名备案需要的材料，各省通信管理局都有规定并且提供申请表加载。申请注销域名备案，需填写“网站备案注销申请表”，注明需注销的域名备案号、备案主体信息、注销原因等。
比如，上海网站用户注销ICP备案的相关资料：
一盖有公章的申请表（个人签字）
二公司企业单位有效许可（如公司提供公司营业执照副本彩色扫描件，个人则身份证彩色扫描件等）
三个人域名注册证书（用于证明域名现在归申请人所有，由域名注册商提供）
注销本公司企业单位或本人备案，请提供资料一二
注销他人备案，请提供资料一二三
