实验过程中产生的有毒气体和废水排放到空气中或下水道，同样对环境造成污染，威胁人们的健康；废弃物如直接丢弃，可能导致土地荒废，污染环境。
实验室在日常分析测试后必然会产生废弃物，其中不乏剧毒物质、致癌物等等，因而实验室垃圾分类及废弃物处理得当是非常重要的。
一、实验室废弃物收集的一般办法
1、分类收集法：按废弃物的类别性质和状态不同，分门别类收集。
2、按量收集法：根据实验过程中排出的废弃物的量的多少或浓度高低予以收集。
3、相似归类收集法：性质或处理方式、方法等相似的废弃物应收集在一起。
4、单独收集法：危险废弃物应予以单独收集处理。
二、处理实验室废弃物的一般方法
1.回收再利用
实验中产生的大量有机废液可以采用蒸馏法进行回收，在满足要求的前提下可重复使用;一些贵重金属可以采用沉淀法、结晶法、吸附法、离子交换法等方法进行回收；实验中的冷却水可以冷却后重新使用。
2.稀释法
实验室废弃物如某些重金属、可溶于水的易燃有机溶剂等，可以做适当稀释后直接排入下水道。具体要求按GB8978污水综合排放标准排放。
3.中和法
强酸类和强碱类实验室废弃物可小心的中和到适当pH后直接排放，若中和后的废液中含有其他有害物质需要做进一步处理。
4.氧化法
硫化物、氰化物、醛类、硫醇和酚类等化合物可以被氧化为低毒和低臭化合物。
在证明废弃物已相当少而又安全时，可以排放到大气或排水沟中；尽量浓缩废液，使其体积变小，放在安全处隔离储存；利用蒸馏、过滤、吸附等方法，将危险物分离，而只弃去安全部分；无论液体或固体，凡能安全燃烧的则燃烧，但数量不宜太大，燃烧时切勿残留在害气体或烧余物，如不能焚烧时，要选择安全场所填埋，不合其裸露在地面上。
危废处置厂家必须办理危险废物经营许可证，必须严格按照营业执照规定的经营范围从事危废处置活动。此外，危险废物处置项目还应设置符合要求的危险废物识别标志，并定期进行环境监测，确保符合《危险废物焚烧污染控制标准》和《危险废物填埋场污染控制标准》的要求。 为应对突发环境事件，还应制定预防措施和应急预案。
