实际上，鱼子酱并不适合长期保存。
身价最不凡的鱼子酱也最容易腐坏。鱼子酱可以通过灭菌（50~70度，1~2个小时）来延长保存期限，但会产生橡胶般的异味，口感也会变得比较轫。
当鱼子酱罐头打开后，一食而尽，最多也只可保存2天。
越是高级的鱼子酱，颗粒越是圆润饱满，色泽清亮透明，甚至微微泛着金黄的光泽，品级越高，鱼子酱里的鱼脂含量相对递增，含盐量则相对递减，口感更黏稠，风味更精致更清扬。
一般鱼子酱在摄氏零下2～4度的温度下可以保存18个月，在冰箱中冷藏就只能保存6～8周。如果来得及保鲜，鱼子酱也可以经过低温杀菌的手续，来提供更久的冷藏保存时间。
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