锰砂滤料主要是依靠其接触氧化能力和吸附能力来除锰，而决定这两项能力的主要因素是滤料表面的二氧化锰含量。现在国内天然锰砂滤料二氧化锰含量一般为30%左右，国家规范除铁锰滤池使用的天然锰砂二氧化锰含量要达到35%以上。而覆合锰砂滤料因为其表面的二氧化锰含量较高较纯，其接触氧化能力和吸附能力都大大超过天然锰砂滤料。
接触氧化能力和吸附能力不仅决定除铁锰效果，还对过滤水的含氧量有要求。地下水含氧量的多少取决于滤前曝气系统的设置，覆合锰砂过滤要求含氧量为水中铁锰离子浓度之和的1.5倍，天然锰砂过滤含氧量要求为3倍。虹吸滤池若使用天然锰砂，曝气环节的设计还需要进一步增加溶氧措施。 2、国家规范天然锰砂滤料设计滤速为5~8米/小时，而覆合锰砂的设计滤速可以达到10米/小时，滤速的取值决定滤池的设计面积，使用天然锰砂的滤池比使用覆合锰砂的滤池面积大25%（{10-8}/ 8×100%=25%），即滤池土建面积需要增加25%才能达到同样的产水量。
覆合锰砂滤料的磨损率为0.07‰，破碎率为0.08‰；天然锰砂滤料的磨损率一般为2.4‰,破碎率为0.2‰。这两项性能决定了滤料的使用寿命，覆合锰砂滤料使用寿命至少相当于天然锰砂滤料的1.5倍以上。
两种锰砂滤料的使用寿命对比：
1、天然锰砂滤料由于机械强度差，装池的时候要求比设计高度多装10%，在经过首次反冲洗冲掉碎末后才能保证设计滤料的设计高度。在以后的使用中每年需要停水检修并补加三分之一的新滤料，第三年全部更换滤料，增加了停水检修时间，也增加了滤池的滤料成本。
2、覆合锰砂滤料可以按照设计高度装池不需要多装，使用寿命保质期三年，即首次装池后，三年内不需要补充滤料.
